Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX74

TM2D1, TM2 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM2D1Q9BX74 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TM2D1Q9BX74 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
TM2D1Q9BX74 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TM2D1Q9BX74 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TM2D1Q9BX74 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TM2D1Q9BX74 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TM2D1Q9BX74 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TM2D1Q9BX74 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TM2D1Q9BX74 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TM2D1Q9BX74 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TM2D1Q9BX74 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TM2D1Q9BX74 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TM2D1Q9BX74 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TM2D1Q9BX74 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TM2D1Q9BX74 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TM2D1Q9BX74 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TM2D1Q9BX74 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TM2D1Q9BX74 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TM2D1Q9BX74 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TM2D1Q9BX74 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TM2D1Q9BX74 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TM2D1Q9BX74 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TM2D1Q9BX74 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TM2D1Q9BX74 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TM2D1Q9BX74 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TM2D1Q9BX74 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TM2D1Q9BX74 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TM2D1Q9BX74 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TM2D1Q9BX74 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TM2D1Q9BX74 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TM2D1Q9BX74 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TM2D1Q9BX74 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TM2D1Q9BX74 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TM2D1Q9BX74 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TM2D1Q9BX74 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TM2D1Q9BX74 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TM2D1Q9BX74 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TM2D1Q9BX74 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TM2D1Q9BX74 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TM2D1Q9BX74 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TM2D1Q9BX74 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TM2D1Q9BX74 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TM2D1Q9BX74 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TM2D1Q9BX74 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TM2D1Q9BX74 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TM2D1Q9BX74 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TM2D1Q9BX74 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TM2D1Q9BX74 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TM2D1Q9BX74 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TM2D1Q9BX74 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TM2D1Q9BX74 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TM2D1Q9BX74 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TM2D1Q9BX74 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TM2D1Q9BX74 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TM2D1Q9BX74 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TM2D1Q9BX74 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TM2D1Q9BX74 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TM2D1Q9BX74 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TM2D1Q9BX74 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TM2D1Q9BX74 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TM2D1Q9BX74 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TM2D1Q9BX74 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TM2D1Q9BX74 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TM2D1Q9BX74 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
TM2D1Q9BX74 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TM2D1Q9BX74 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TM2D1Q9BX74 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TM2D1Q9BX74 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TM2D1Q9BX74 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TM2D1Q9BX74 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TM2D1Q9BX74 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TM2D1Q9BX74 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TM2D1Q9BX74 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
TM2D1Q9BX74 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TM2D1Q9BX74 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TM2D1Q9BX74 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
TM2D1Q9BX74 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TM2D1Q9BX74 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TM2D1Q9BX74 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
TM2D1Q9BX74 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TM2D1Q9BX74 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TM2D1Q9BX74 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TM2D1Q9BX74 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TM2D1Q9BX74 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TM2D1Q9BX74 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TM2D1Q9BX74 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TM2D1Q9BX74 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TM2D1Q9BX74 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TM2D1Q9BX74 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TM2D1Q9BX74 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TM2D1Q9BX74 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TM2D1Q9BX74 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TM2D1Q9BX74 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TM2D1Q9BX74 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TM2D1Q9BX74 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TM2D1Q9BX74 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TM2D1Q9BX74 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TM2D1Q9BX74 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TM2D1Q9BX74 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TM2D1Q9BX74 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms