Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWJ5

SF3B5, Splicing factor 3B subunit 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B5Q9BWJ5 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SF3B5Q9BWJ5 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SF3B5Q9BWJ5 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SF3B5Q9BWJ5 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SF3B5Q9BWJ5 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SF3B5Q9BWJ5 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SF3B5Q9BWJ5 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SF3B5Q9BWJ5 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SF3B5Q9BWJ5 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SF3B5Q9BWJ5 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SF3B5Q9BWJ5 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SF3B5Q9BWJ5 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SF3B5Q9BWJ5 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SF3B5Q9BWJ5 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SF3B5Q9BWJ5 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SF3B5Q9BWJ5 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SF3B5Q9BWJ5 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SF3B5Q9BWJ5 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SF3B5Q9BWJ5 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SF3B5Q9BWJ5 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SF3B5Q9BWJ5 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SF3B5Q9BWJ5 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SF3B5Q9BWJ5 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SF3B5Q9BWJ5 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SF3B5Q9BWJ5 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SF3B5Q9BWJ5 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SF3B5Q9BWJ5 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SF3B5Q9BWJ5 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SF3B5Q9BWJ5 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SF3B5Q9BWJ5 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SF3B5Q9BWJ5 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SF3B5Q9BWJ5 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SF3B5Q9BWJ5 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SF3B5Q9BWJ5 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SF3B5Q9BWJ5 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SF3B5Q9BWJ5 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SF3B5Q9BWJ5 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SF3B5Q9BWJ5 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SF3B5Q9BWJ5 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SF3B5Q9BWJ5 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SF3B5Q9BWJ5 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SF3B5Q9BWJ5 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SF3B5Q9BWJ5 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SF3B5Q9BWJ5 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SF3B5Q9BWJ5 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SF3B5Q9BWJ5 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SF3B5Q9BWJ5 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SF3B5Q9BWJ5 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SF3B5Q9BWJ5 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SF3B5Q9BWJ5 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SF3B5Q9BWJ5 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SF3B5Q9BWJ5 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SF3B5Q9BWJ5 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SF3B5Q9BWJ5 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SF3B5Q9BWJ5 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SF3B5Q9BWJ5 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SF3B5Q9BWJ5 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SF3B5Q9BWJ5 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SF3B5Q9BWJ5 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SF3B5Q9BWJ5 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SF3B5Q9BWJ5 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SF3B5Q9BWJ5 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SF3B5Q9BWJ5 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SF3B5Q9BWJ5 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SF3B5Q9BWJ5 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SF3B5Q9BWJ5 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SF3B5Q9BWJ5 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SF3B5Q9BWJ5 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SF3B5Q9BWJ5 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SF3B5Q9BWJ5 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SF3B5Q9BWJ5 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SF3B5Q9BWJ5 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SF3B5Q9BWJ5 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SF3B5Q9BWJ5 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SF3B5Q9BWJ5 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SF3B5Q9BWJ5 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SF3B5Q9BWJ5 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SF3B5Q9BWJ5 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SF3B5Q9BWJ5 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SF3B5Q9BWJ5 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SF3B5Q9BWJ5 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SF3B5Q9BWJ5 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SF3B5Q9BWJ5 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SF3B5Q9BWJ5 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SF3B5Q9BWJ5 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SF3B5Q9BWJ5 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SF3B5Q9BWJ5 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SF3B5Q9BWJ5 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SF3B5Q9BWJ5 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SF3B5Q9BWJ5 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SF3B5Q9BWJ5 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SF3B5Q9BWJ5 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SF3B5Q9BWJ5 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SF3B5Q9BWJ5 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SF3B5Q9BWJ5 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SF3B5Q9BWJ5 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SF3B5Q9BWJ5 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SF3B5Q9BWJ5 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SF3B5Q9BWJ5 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SF3B5Q9BWJ5 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms