Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWF2

TRAIP, E3 ubiquitin-protein ligase TRAIP, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAIPQ9BWF2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRAIPQ9BWF2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRAIPQ9BWF2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRAIPQ9BWF2 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRAIPQ9BWF2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRAIPQ9BWF2 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRAIPQ9BWF2 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRAIPQ9BWF2 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRAIPQ9BWF2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRAIPQ9BWF2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRAIPQ9BWF2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRAIPQ9BWF2 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TRAIPQ9BWF2 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRAIPQ9BWF2 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRAIPQ9BWF2 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRAIPQ9BWF2 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRAIPQ9BWF2 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRAIPQ9BWF2 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRAIPQ9BWF2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRAIPQ9BWF2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRAIPQ9BWF2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRAIPQ9BWF2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRAIPQ9BWF2 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRAIPQ9BWF2 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRAIPQ9BWF2 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRAIPQ9BWF2 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRAIPQ9BWF2 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TRAIPQ9BWF2 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TRAIPQ9BWF2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRAIPQ9BWF2 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRAIPQ9BWF2 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRAIPQ9BWF2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRAIPQ9BWF2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRAIPQ9BWF2 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRAIPQ9BWF2 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRAIPQ9BWF2 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRAIPQ9BWF2 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRAIPQ9BWF2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAIPQ9BWF2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAIPQ9BWF2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAIPQ9BWF2 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAIPQ9BWF2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAIPQ9BWF2 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAIPQ9BWF2 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAIPQ9BWF2 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAIPQ9BWF2 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAIPQ9BWF2 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAIPQ9BWF2 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAIPQ9BWF2 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAIPQ9BWF2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAIPQ9BWF2 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAIPQ9BWF2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRAIPQ9BWF2 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRAIPQ9BWF2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRAIPQ9BWF2 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRAIPQ9BWF2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRAIPQ9BWF2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRAIPQ9BWF2 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRAIPQ9BWF2 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TRAIPQ9BWF2 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TRAIPQ9BWF2 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TRAIPQ9BWF2 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TRAIPQ9BWF2 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TRAIPQ9BWF2 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRAIPQ9BWF2 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRAIPQ9BWF2 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAIPQ9BWF2 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAIPQ9BWF2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAIPQ9BWF2 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAIPQ9BWF2 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAIPQ9BWF2 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAIPQ9BWF2 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAIPQ9BWF2 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAIPQ9BWF2 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAIPQ9BWF2 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAIPQ9BWF2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRAIPQ9BWF2 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRAIPQ9BWF2 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRAIPQ9BWF2 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRAIPQ9BWF2 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TRAIPQ9BWF2 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TRAIPQ9BWF2 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRAIPQ9BWF2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TRAIPQ9BWF2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRAIPQ9BWF2 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAIPQ9BWF2 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAIPQ9BWF2 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAIPQ9BWF2 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAIPQ9BWF2 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAIPQ9BWF2 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAIPQ9BWF2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAIPQ9BWF2 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRAIPQ9BWF2 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRAIPQ9BWF2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRAIPQ9BWF2 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TRAIPQ9BWF2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRAIPQ9BWF2 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRAIPQ9BWF2 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRAIPQ9BWF2 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRAIPQ9BWF2 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms