Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW85

CCDC94, Coiled-coil domain-containing protein 94, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC94Q9BW85 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC94Q9BW85 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC94Q9BW85 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC94Q9BW85 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC94Q9BW85 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC94Q9BW85 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC94Q9BW85 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC94Q9BW85 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC94Q9BW85 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC94Q9BW85 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC94Q9BW85 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC94Q9BW85 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC94Q9BW85 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC94Q9BW85 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC94Q9BW85 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC94Q9BW85 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC94Q9BW85 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC94Q9BW85 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC94Q9BW85 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CCDC94Q9BW85 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CCDC94Q9BW85 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CCDC94Q9BW85 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC94Q9BW85 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC94Q9BW85 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC94Q9BW85 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC94Q9BW85 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC94Q9BW85 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC94Q9BW85 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC94Q9BW85 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC94Q9BW85 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC94Q9BW85 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC94Q9BW85 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC94Q9BW85 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC94Q9BW85 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC94Q9BW85 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC94Q9BW85 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC94Q9BW85 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC94Q9BW85 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC94Q9BW85 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC94Q9BW85 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC94Q9BW85 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC94Q9BW85 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC94Q9BW85 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC94Q9BW85 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC94Q9BW85 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC94Q9BW85 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC94Q9BW85 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC94Q9BW85 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC94Q9BW85 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC94Q9BW85 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC94Q9BW85 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC94Q9BW85 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC94Q9BW85 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC94Q9BW85 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC94Q9BW85 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC94Q9BW85 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC94Q9BW85 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC94Q9BW85 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC94Q9BW85 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC94Q9BW85 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC94Q9BW85 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC94Q9BW85 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC94Q9BW85 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC94Q9BW85 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC94Q9BW85 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC94Q9BW85 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC94Q9BW85 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC94Q9BW85 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC94Q9BW85 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC94Q9BW85 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC94Q9BW85 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC94Q9BW85 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC94Q9BW85 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC94Q9BW85 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC94Q9BW85 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC94Q9BW85 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC94Q9BW85 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC94Q9BW85 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC94Q9BW85 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC94Q9BW85 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC94Q9BW85 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC94Q9BW85 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC94Q9BW85 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC94Q9BW85 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC94Q9BW85 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC94Q9BW85 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC94Q9BW85 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC94Q9BW85 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC94Q9BW85 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC94Q9BW85 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC94Q9BW85 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC94Q9BW85 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC94Q9BW85 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC94Q9BW85 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC94Q9BW85 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC94Q9BW85 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC94Q9BW85 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC94Q9BW85 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC94Q9BW85 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC94Q9BW85 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms