Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV99

LRRC61, Leucine-rich repeat-containing protein 61, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC61Q9BV99 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC61Q9BV99 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC61Q9BV99 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC61Q9BV99 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC61Q9BV99 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC61Q9BV99 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC61Q9BV99 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC61Q9BV99 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC61Q9BV99 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
LRRC61Q9BV99 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
LRRC61Q9BV99 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC61Q9BV99 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC61Q9BV99 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC61Q9BV99 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC61Q9BV99 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC61Q9BV99 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC61Q9BV99 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC61Q9BV99 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC61Q9BV99 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC61Q9BV99 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC61Q9BV99 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC61Q9BV99 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC61Q9BV99 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC61Q9BV99 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC61Q9BV99 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC61Q9BV99 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC61Q9BV99 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC61Q9BV99 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC61Q9BV99 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC61Q9BV99 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC61Q9BV99 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC61Q9BV99 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC61Q9BV99 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC61Q9BV99 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC61Q9BV99 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC61Q9BV99 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC61Q9BV99 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC61Q9BV99 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC61Q9BV99 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC61Q9BV99 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC61Q9BV99 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC61Q9BV99 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC61Q9BV99 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC61Q9BV99 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC61Q9BV99 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC61Q9BV99 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC61Q9BV99 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC61Q9BV99 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC61Q9BV99 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC61Q9BV99 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC61Q9BV99 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC61Q9BV99 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC61Q9BV99 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC61Q9BV99 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC61Q9BV99 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC61Q9BV99 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC61Q9BV99 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC61Q9BV99 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC61Q9BV99 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC61Q9BV99 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC61Q9BV99 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC61Q9BV99 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC61Q9BV99 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC61Q9BV99 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC61Q9BV99 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC61Q9BV99 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC61Q9BV99 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC61Q9BV99 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC61Q9BV99 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC61Q9BV99 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC61Q9BV99 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC61Q9BV99 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC61Q9BV99 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC61Q9BV99 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC61Q9BV99 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC61Q9BV99 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC61Q9BV99 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LRRC61Q9BV99 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LRRC61Q9BV99 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC61Q9BV99 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC61Q9BV99 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC61Q9BV99 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC61Q9BV99 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC61Q9BV99 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC61Q9BV99 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC61Q9BV99 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC61Q9BV99 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC61Q9BV99 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC61Q9BV99 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC61Q9BV99 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC61Q9BV99 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC61Q9BV99 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC61Q9BV99 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC61Q9BV99 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC61Q9BV99 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC61Q9BV99 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC61Q9BV99 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC61Q9BV99 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC61Q9BV99 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC61Q9BV99 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms