Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
C9orf16Q9BUW7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
C9orf16Q9BUW7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
C9orf16Q9BUW7 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
C9orf16Q9BUW7 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
C9orf16Q9BUW7 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
C9orf16Q9BUW7 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
C9orf16Q9BUW7 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
C9orf16Q9BUW7 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
C9orf16Q9BUW7 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
C9orf16Q9BUW7 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
C9orf16Q9BUW7 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
C9orf16Q9BUW7 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
C9orf16Q9BUW7 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
C9orf16Q9BUW7 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
C9orf16Q9BUW7 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
C9orf16Q9BUW7 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
C9orf16Q9BUW7 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
C9orf16Q9BUW7 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
C9orf16Q9BUW7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
C9orf16Q9BUW7 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
C9orf16Q9BUW7 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
C9orf16Q9BUW7 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
C9orf16Q9BUW7 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
C9orf16Q9BUW7 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
C9orf16Q9BUW7 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
C9orf16Q9BUW7 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
C9orf16Q9BUW7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
C9orf16Q9BUW7 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
C9orf16Q9BUW7 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C9orf16Q9BUW7 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
C9orf16Q9BUW7 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
C9orf16Q9BUW7 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C9orf16Q9BUW7 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
C9orf16Q9BUW7 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
C9orf16Q9BUW7 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
C9orf16Q9BUW7 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
C9orf16Q9BUW7 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C9orf16Q9BUW7 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C9orf16Q9BUW7 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
C9orf16Q9BUW7 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
C9orf16Q9BUW7 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
C9orf16Q9BUW7 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
C9orf16Q9BUW7 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
C9orf16Q9BUW7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
C9orf16Q9BUW7 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C9orf16Q9BUW7 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C9orf16Q9BUW7 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C9orf16Q9BUW7 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
C9orf16Q9BUW7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C9orf16Q9BUW7 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C9orf16Q9BUW7 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
C9orf16Q9BUW7 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
C9orf16Q9BUW7 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
C9orf16Q9BUW7 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
C9orf16Q9BUW7 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
C9orf16Q9BUW7 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
C9orf16Q9BUW7 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C9orf16Q9BUW7 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
C9orf16Q9BUW7 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
C9orf16Q9BUW7 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
C9orf16Q9BUW7 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
C9orf16Q9BUW7 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
C9orf16Q9BUW7 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
C9orf16Q9BUW7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
C9orf16Q9BUW7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
C9orf16Q9BUW7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
C9orf16Q9BUW7 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
C9orf16Q9BUW7 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
C9orf16Q9BUW7 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
C9orf16Q9BUW7 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
C9orf16Q9BUW7 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
C9orf16Q9BUW7 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
C9orf16Q9BUW7 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
C9orf16Q9BUW7 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
C9orf16Q9BUW7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
C9orf16Q9BUW7 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
C9orf16Q9BUW7 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
C9orf16Q9BUW7 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
C9orf16Q9BUW7 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
C9orf16Q9BUW7 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
C9orf16Q9BUW7 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
C9orf16Q9BUW7 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
C9orf16Q9BUW7 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
C9orf16Q9BUW7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
C9orf16Q9BUW7 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
C9orf16Q9BUW7 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
C9orf16Q9BUW7 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
C9orf16Q9BUW7 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
C9orf16Q9BUW7 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
C9orf16Q9BUW7 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
C9orf16Q9BUW7 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
C9orf16Q9BUW7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
C9orf16Q9BUW7 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
C9orf16Q9BUW7 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
C9orf16Q9BUW7 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
C9orf16Q9BUW7 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
C9orf16Q9BUW7 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
C9orf16Q9BUW7 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
C9orf16Q9BUW7 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms