Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTP6

ZBED2, Zinc finger BED domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED2Q9BTP6 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZBED2Q9BTP6 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZBED2Q9BTP6 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZBED2Q9BTP6 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZBED2Q9BTP6 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZBED2Q9BTP6 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ZBED2Q9BTP6 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ZBED2Q9BTP6 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ZBED2Q9BTP6 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZBED2Q9BTP6 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZBED2Q9BTP6 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZBED2Q9BTP6 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZBED2Q9BTP6 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZBED2Q9BTP6 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZBED2Q9BTP6 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ZBED2Q9BTP6 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZBED2Q9BTP6 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZBED2Q9BTP6 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZBED2Q9BTP6 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZBED2Q9BTP6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZBED2Q9BTP6 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZBED2Q9BTP6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZBED2Q9BTP6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZBED2Q9BTP6 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZBED2Q9BTP6 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZBED2Q9BTP6 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZBED2Q9BTP6 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZBED2Q9BTP6 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZBED2Q9BTP6 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ZBED2Q9BTP6 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ZBED2Q9BTP6 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ZBED2Q9BTP6 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ZBED2Q9BTP6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZBED2Q9BTP6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZBED2Q9BTP6 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZBED2Q9BTP6 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZBED2Q9BTP6 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZBED2Q9BTP6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZBED2Q9BTP6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZBED2Q9BTP6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZBED2Q9BTP6 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZBED2Q9BTP6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZBED2Q9BTP6 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZBED2Q9BTP6 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZBED2Q9BTP6 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ZBED2Q9BTP6 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZBED2Q9BTP6 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZBED2Q9BTP6 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZBED2Q9BTP6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZBED2Q9BTP6 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZBED2Q9BTP6 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZBED2Q9BTP6 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ZBED2Q9BTP6 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZBED2Q9BTP6 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZBED2Q9BTP6 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ZBED2Q9BTP6 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ZBED2Q9BTP6 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ZBED2Q9BTP6 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ZBED2Q9BTP6 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ZBED2Q9BTP6 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ZBED2Q9BTP6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZBED2Q9BTP6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZBED2Q9BTP6 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZBED2Q9BTP6 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZBED2Q9BTP6 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZBED2Q9BTP6 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZBED2Q9BTP6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZBED2Q9BTP6 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZBED2Q9BTP6 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZBED2Q9BTP6 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZBED2Q9BTP6 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZBED2Q9BTP6 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZBED2Q9BTP6 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZBED2Q9BTP6 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ZBED2Q9BTP6 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ZBED2Q9BTP6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZBED2Q9BTP6 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZBED2Q9BTP6 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ZBED2Q9BTP6 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZBED2Q9BTP6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZBED2Q9BTP6 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZBED2Q9BTP6 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZBED2Q9BTP6 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ZBED2Q9BTP6 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZBED2Q9BTP6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZBED2Q9BTP6 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZBED2Q9BTP6 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZBED2Q9BTP6 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZBED2Q9BTP6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZBED2Q9BTP6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZBED2Q9BTP6 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZBED2Q9BTP6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZBED2Q9BTP6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZBED2Q9BTP6 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZBED2Q9BTP6 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZBED2Q9BTP6 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZBED2Q9BTP6 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZBED2Q9BTP6 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZBED2Q9BTP6 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZBED2Q9BTP6 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms