Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRU9

UTP23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP23Q9BRU9 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
UTP23Q9BRU9 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
UTP23Q9BRU9 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
UTP23Q9BRU9 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
UTP23Q9BRU9 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
UTP23Q9BRU9 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
UTP23Q9BRU9 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
UTP23Q9BRU9 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
UTP23Q9BRU9 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
UTP23Q9BRU9 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
UTP23Q9BRU9 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
UTP23Q9BRU9 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
UTP23Q9BRU9 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
UTP23Q9BRU9 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
UTP23Q9BRU9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
UTP23Q9BRU9 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
UTP23Q9BRU9 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
UTP23Q9BRU9 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
UTP23Q9BRU9 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
UTP23Q9BRU9 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
UTP23Q9BRU9 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
UTP23Q9BRU9 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
UTP23Q9BRU9 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
UTP23Q9BRU9 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
UTP23Q9BRU9 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
UTP23Q9BRU9 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
UTP23Q9BRU9 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
UTP23Q9BRU9 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
UTP23Q9BRU9 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
UTP23Q9BRU9 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
UTP23Q9BRU9 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
UTP23Q9BRU9 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
UTP23Q9BRU9 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
UTP23Q9BRU9 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
UTP23Q9BRU9 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
UTP23Q9BRU9 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
UTP23Q9BRU9 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
UTP23Q9BRU9 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
UTP23Q9BRU9 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
UTP23Q9BRU9 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
UTP23Q9BRU9 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
UTP23Q9BRU9 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
UTP23Q9BRU9 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
UTP23Q9BRU9 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
UTP23Q9BRU9 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
UTP23Q9BRU9 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
UTP23Q9BRU9 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
UTP23Q9BRU9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
UTP23Q9BRU9 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
UTP23Q9BRU9 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
UTP23Q9BRU9 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
UTP23Q9BRU9 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
UTP23Q9BRU9 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
UTP23Q9BRU9 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
UTP23Q9BRU9 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
UTP23Q9BRU9 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
UTP23Q9BRU9 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
UTP23Q9BRU9 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
UTP23Q9BRU9 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
UTP23Q9BRU9 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
UTP23Q9BRU9 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
UTP23Q9BRU9 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
UTP23Q9BRU9 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
UTP23Q9BRU9 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
UTP23Q9BRU9 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
UTP23Q9BRU9 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
UTP23Q9BRU9 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
UTP23Q9BRU9 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
UTP23Q9BRU9 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
UTP23Q9BRU9 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
UTP23Q9BRU9 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
UTP23Q9BRU9 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
UTP23Q9BRU9 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
UTP23Q9BRU9 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
UTP23Q9BRU9 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
UTP23Q9BRU9 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
UTP23Q9BRU9 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
UTP23Q9BRU9 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
UTP23Q9BRU9 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
UTP23Q9BRU9 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
UTP23Q9BRU9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
UTP23Q9BRU9 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
UTP23Q9BRU9 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
UTP23Q9BRU9 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
UTP23Q9BRU9 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
UTP23Q9BRU9 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
UTP23Q9BRU9 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
UTP23Q9BRU9 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
UTP23Q9BRU9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
UTP23Q9BRU9 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
UTP23Q9BRU9 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
UTP23Q9BRU9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
UTP23Q9BRU9 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
UTP23Q9BRU9 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
UTP23Q9BRU9 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
UTP23Q9BRU9 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
UTP23Q9BRU9 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
UTP23Q9BRU9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
UTP23Q9BRU9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
UTP23Q9BRU9 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 135.4 ms