Protein–RNA interactions for Protein: Q99732

LITAF, Lipopolysaccharide-induced tumor necrosis factor-alpha factor, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LITAFQ99732 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LITAFQ99732 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LITAFQ99732 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LITAFQ99732 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LITAFQ99732 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LITAFQ99732 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LITAFQ99732 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LITAFQ99732 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LITAFQ99732 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LITAFQ99732 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LITAFQ99732 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LITAFQ99732 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LITAFQ99732 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LITAFQ99732 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LITAFQ99732 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LITAFQ99732 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LITAFQ99732 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LITAFQ99732 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LITAFQ99732 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LITAFQ99732 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LITAFQ99732 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LITAFQ99732 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LITAFQ99732 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LITAFQ99732 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LITAFQ99732 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LITAFQ99732 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LITAFQ99732 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LITAFQ99732 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LITAFQ99732 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LITAFQ99732 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LITAFQ99732 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LITAFQ99732 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LITAFQ99732 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LITAFQ99732 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LITAFQ99732 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LITAFQ99732 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LITAFQ99732 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LITAFQ99732 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LITAFQ99732 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LITAFQ99732 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LITAFQ99732 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LITAFQ99732 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LITAFQ99732 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LITAFQ99732 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LITAFQ99732 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LITAFQ99732 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LITAFQ99732 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LITAFQ99732 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LITAFQ99732 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LITAFQ99732 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LITAFQ99732 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LITAFQ99732 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LITAFQ99732 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LITAFQ99732 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LITAFQ99732 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LITAFQ99732 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LITAFQ99732 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LITAFQ99732 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LITAFQ99732 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LITAFQ99732 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LITAFQ99732 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LITAFQ99732 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LITAFQ99732 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LITAFQ99732 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LITAFQ99732 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LITAFQ99732 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LITAFQ99732 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LITAFQ99732 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LITAFQ99732 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LITAFQ99732 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LITAFQ99732 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LITAFQ99732 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LITAFQ99732 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LITAFQ99732 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LITAFQ99732 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LITAFQ99732 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LITAFQ99732 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LITAFQ99732 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LITAFQ99732 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LITAFQ99732 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LITAFQ99732 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LITAFQ99732 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LITAFQ99732 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LITAFQ99732 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LITAFQ99732 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LITAFQ99732 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LITAFQ99732 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LITAFQ99732 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LITAFQ99732 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LITAFQ99732 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LITAFQ99732 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LITAFQ99732 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LITAFQ99732 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LITAFQ99732 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LITAFQ99732 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LITAFQ99732 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LITAFQ99732 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LITAFQ99732 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LITAFQ99732 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LITAFQ99732 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms