Protein–RNA interactions for Protein: Q99698

LYST, Lysosomal-trafficking regulator, humanhuman

Predictions only

Length 3,801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYSTQ99698 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LYSTQ99698 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LYSTQ99698 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LYSTQ99698 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LYSTQ99698 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LYSTQ99698 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LYSTQ99698 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LYSTQ99698 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
LYSTQ99698 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LYSTQ99698 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LYSTQ99698 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LYSTQ99698 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LYSTQ99698 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LYSTQ99698 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LYSTQ99698 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LYSTQ99698 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LYSTQ99698 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LYSTQ99698 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LYSTQ99698 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LYSTQ99698 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LYSTQ99698 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LYSTQ99698 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LYSTQ99698 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LYSTQ99698 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LYSTQ99698 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LYSTQ99698 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LYSTQ99698 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LYSTQ99698 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LYSTQ99698 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LYSTQ99698 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LYSTQ99698 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LYSTQ99698 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LYSTQ99698 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LYSTQ99698 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LYSTQ99698 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LYSTQ99698 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LYSTQ99698 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LYSTQ99698 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LYSTQ99698 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LYSTQ99698 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LYSTQ99698 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LYSTQ99698 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LYSTQ99698 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LYSTQ99698 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LYSTQ99698 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LYSTQ99698 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LYSTQ99698 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LYSTQ99698 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LYSTQ99698 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LYSTQ99698 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LYSTQ99698 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LYSTQ99698 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LYSTQ99698 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LYSTQ99698 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LYSTQ99698 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LYSTQ99698 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LYSTQ99698 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LYSTQ99698 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LYSTQ99698 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LYSTQ99698 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LYSTQ99698 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LYSTQ99698 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LYSTQ99698 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LYSTQ99698 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LYSTQ99698 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LYSTQ99698 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LYSTQ99698 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LYSTQ99698 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LYSTQ99698 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LYSTQ99698 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LYSTQ99698 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LYSTQ99698 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LYSTQ99698 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LYSTQ99698 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LYSTQ99698 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LYSTQ99698 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LYSTQ99698 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LYSTQ99698 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LYSTQ99698 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LYSTQ99698 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
LYSTQ99698 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
LYSTQ99698 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.13
LYSTQ99698 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
LYSTQ99698 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LYSTQ99698 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
LYSTQ99698 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LYSTQ99698 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LYSTQ99698 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LYSTQ99698 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LYSTQ99698 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LYSTQ99698 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LYSTQ99698 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LYSTQ99698 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LYSTQ99698 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LYSTQ99698 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LYSTQ99698 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LYSTQ99698 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LYSTQ99698 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LYSTQ99698 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LYSTQ99698 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms