Protein–RNA interactions for Protein: Q99653

CHP1, Calcineurin B homologous protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHP1Q99653 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHP1Q99653 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHP1Q99653 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHP1Q99653 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHP1Q99653 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHP1Q99653 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHP1Q99653 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHP1Q99653 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHP1Q99653 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHP1Q99653 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHP1Q99653 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHP1Q99653 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHP1Q99653 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHP1Q99653 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHP1Q99653 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHP1Q99653 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHP1Q99653 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHP1Q99653 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHP1Q99653 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHP1Q99653 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CHP1Q99653 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CHP1Q99653 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHP1Q99653 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHP1Q99653 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHP1Q99653 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHP1Q99653 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CHP1Q99653 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHP1Q99653 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CHP1Q99653 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHP1Q99653 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHP1Q99653 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHP1Q99653 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHP1Q99653 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHP1Q99653 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHP1Q99653 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHP1Q99653 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHP1Q99653 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CHP1Q99653 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHP1Q99653 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHP1Q99653 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHP1Q99653 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHP1Q99653 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHP1Q99653 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHP1Q99653 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHP1Q99653 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHP1Q99653 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHP1Q99653 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHP1Q99653 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHP1Q99653 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHP1Q99653 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHP1Q99653 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CHP1Q99653 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHP1Q99653 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHP1Q99653 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHP1Q99653 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHP1Q99653 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHP1Q99653 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHP1Q99653 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHP1Q99653 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHP1Q99653 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHP1Q99653 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHP1Q99653 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHP1Q99653 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHP1Q99653 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHP1Q99653 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHP1Q99653 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHP1Q99653 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHP1Q99653 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHP1Q99653 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHP1Q99653 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHP1Q99653 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHP1Q99653 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHP1Q99653 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHP1Q99653 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHP1Q99653 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHP1Q99653 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHP1Q99653 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHP1Q99653 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHP1Q99653 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHP1Q99653 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHP1Q99653 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHP1Q99653 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHP1Q99653 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHP1Q99653 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHP1Q99653 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHP1Q99653 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CHP1Q99653 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHP1Q99653 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHP1Q99653 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CHP1Q99653 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHP1Q99653 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHP1Q99653 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CHP1Q99653 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHP1Q99653 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHP1Q99653 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHP1Q99653 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHP1Q99653 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHP1Q99653 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHP1Q99653 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHP1Q99653 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms