Protein–RNA interactions for Protein: Q99567

NUP88, Nuclear pore complex protein Nup88, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP88Q99567 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NUP88Q99567 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NUP88Q99567 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NUP88Q99567 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NUP88Q99567 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NUP88Q99567 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NUP88Q99567 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NUP88Q99567 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NUP88Q99567 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NUP88Q99567 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NUP88Q99567 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NUP88Q99567 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NUP88Q99567 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NUP88Q99567 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NUP88Q99567 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NUP88Q99567 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NUP88Q99567 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NUP88Q99567 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NUP88Q99567 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NUP88Q99567 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NUP88Q99567 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NUP88Q99567 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NUP88Q99567 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NUP88Q99567 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NUP88Q99567 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NUP88Q99567 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NUP88Q99567 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NUP88Q99567 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
NUP88Q99567 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
NUP88Q99567 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NUP88Q99567 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
NUP88Q99567 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NUP88Q99567 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NUP88Q99567 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NUP88Q99567 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NUP88Q99567 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NUP88Q99567 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NUP88Q99567 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NUP88Q99567 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NUP88Q99567 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NUP88Q99567 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NUP88Q99567 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NUP88Q99567 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NUP88Q99567 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NUP88Q99567 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NUP88Q99567 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NUP88Q99567 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NUP88Q99567 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NUP88Q99567 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
NUP88Q99567 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NUP88Q99567 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
NUP88Q99567 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NUP88Q99567 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NUP88Q99567 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
NUP88Q99567 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NUP88Q99567 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NUP88Q99567 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NUP88Q99567 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NUP88Q99567 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NUP88Q99567 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
NUP88Q99567 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
NUP88Q99567 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NUP88Q99567 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NUP88Q99567 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NUP88Q99567 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NUP88Q99567 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NUP88Q99567 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NUP88Q99567 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NUP88Q99567 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NUP88Q99567 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
NUP88Q99567 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
NUP88Q99567 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
NUP88Q99567 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NUP88Q99567 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NUP88Q99567 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NUP88Q99567 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
NUP88Q99567 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NUP88Q99567 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
NUP88Q99567 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
NUP88Q99567 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NUP88Q99567 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NUP88Q99567 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NUP88Q99567 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NUP88Q99567 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NUP88Q99567 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NUP88Q99567 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NUP88Q99567 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NUP88Q99567 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NUP88Q99567 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
NUP88Q99567 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NUP88Q99567 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NUP88Q99567 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NUP88Q99567 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NUP88Q99567 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NUP88Q99567 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NUP88Q99567 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NUP88Q99567 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NUP88Q99567 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NUP88Q99567 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NUP88Q99567 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms