Protein–RNA interactions for Protein: Q96S82

UBL7, Ubiquitin-like protein 7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBL7Q96S82 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBL7Q96S82 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBL7Q96S82 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBL7Q96S82 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBL7Q96S82 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBL7Q96S82 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBL7Q96S82 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBL7Q96S82 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBL7Q96S82 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBL7Q96S82 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBL7Q96S82 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBL7Q96S82 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBL7Q96S82 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBL7Q96S82 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
UBL7Q96S82 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBL7Q96S82 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBL7Q96S82 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBL7Q96S82 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBL7Q96S82 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBL7Q96S82 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
UBL7Q96S82 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBL7Q96S82 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBL7Q96S82 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBL7Q96S82 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBL7Q96S82 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBL7Q96S82 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBL7Q96S82 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBL7Q96S82 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
UBL7Q96S82 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBL7Q96S82 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBL7Q96S82 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
UBL7Q96S82 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBL7Q96S82 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBL7Q96S82 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBL7Q96S82 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBL7Q96S82 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBL7Q96S82 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBL7Q96S82 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBL7Q96S82 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBL7Q96S82 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBL7Q96S82 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBL7Q96S82 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBL7Q96S82 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBL7Q96S82 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBL7Q96S82 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBL7Q96S82 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBL7Q96S82 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBL7Q96S82 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBL7Q96S82 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBL7Q96S82 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBL7Q96S82 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
UBL7Q96S82 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBL7Q96S82 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBL7Q96S82 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBL7Q96S82 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBL7Q96S82 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBL7Q96S82 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBL7Q96S82 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBL7Q96S82 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBL7Q96S82 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBL7Q96S82 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
UBL7Q96S82 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBL7Q96S82 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBL7Q96S82 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBL7Q96S82 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBL7Q96S82 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBL7Q96S82 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBL7Q96S82 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
UBL7Q96S82 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBL7Q96S82 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBL7Q96S82 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBL7Q96S82 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBL7Q96S82 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBL7Q96S82 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBL7Q96S82 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBL7Q96S82 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBL7Q96S82 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBL7Q96S82 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBL7Q96S82 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBL7Q96S82 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
UBL7Q96S82 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBL7Q96S82 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBL7Q96S82 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBL7Q96S82 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBL7Q96S82 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBL7Q96S82 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBL7Q96S82 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBL7Q96S82 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBL7Q96S82 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBL7Q96S82 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
UBL7Q96S82 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBL7Q96S82 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBL7Q96S82 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBL7Q96S82 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
UBL7Q96S82 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
UBL7Q96S82 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBL7Q96S82 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
UBL7Q96S82 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
UBL7Q96S82 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
UBL7Q96S82 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms