Protein–RNA interactions for Protein: Q96QD5

DEPDC7, DEP domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEPDC7Q96QD5 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
DEPDC7Q96QD5 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
DEPDC7Q96QD5 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DEPDC7Q96QD5 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DEPDC7Q96QD5 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DEPDC7Q96QD5 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DEPDC7Q96QD5 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DEPDC7Q96QD5 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DEPDC7Q96QD5 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DEPDC7Q96QD5 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DEPDC7Q96QD5 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DEPDC7Q96QD5 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
DEPDC7Q96QD5 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DEPDC7Q96QD5 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DEPDC7Q96QD5 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DEPDC7Q96QD5 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DEPDC7Q96QD5 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DEPDC7Q96QD5 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DEPDC7Q96QD5 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DEPDC7Q96QD5 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DEPDC7Q96QD5 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DEPDC7Q96QD5 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DEPDC7Q96QD5 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DEPDC7Q96QD5 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DEPDC7Q96QD5 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DEPDC7Q96QD5 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DEPDC7Q96QD5 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DEPDC7Q96QD5 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DEPDC7Q96QD5 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DEPDC7Q96QD5 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DEPDC7Q96QD5 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DEPDC7Q96QD5 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DEPDC7Q96QD5 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DEPDC7Q96QD5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DEPDC7Q96QD5 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
DEPDC7Q96QD5 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DEPDC7Q96QD5 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DEPDC7Q96QD5 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DEPDC7Q96QD5 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DEPDC7Q96QD5 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DEPDC7Q96QD5 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DEPDC7Q96QD5 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DEPDC7Q96QD5 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DEPDC7Q96QD5 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DEPDC7Q96QD5 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DEPDC7Q96QD5 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DEPDC7Q96QD5 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DEPDC7Q96QD5 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DEPDC7Q96QD5 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DEPDC7Q96QD5 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DEPDC7Q96QD5 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DEPDC7Q96QD5 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
DEPDC7Q96QD5 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
DEPDC7Q96QD5 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DEPDC7Q96QD5 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DEPDC7Q96QD5 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
DEPDC7Q96QD5 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
DEPDC7Q96QD5 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DEPDC7Q96QD5 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DEPDC7Q96QD5 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DEPDC7Q96QD5 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
DEPDC7Q96QD5 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DEPDC7Q96QD5 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DEPDC7Q96QD5 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DEPDC7Q96QD5 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DEPDC7Q96QD5 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DEPDC7Q96QD5 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DEPDC7Q96QD5 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DEPDC7Q96QD5 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DEPDC7Q96QD5 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DEPDC7Q96QD5 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DEPDC7Q96QD5 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DEPDC7Q96QD5 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DEPDC7Q96QD5 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DEPDC7Q96QD5 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DEPDC7Q96QD5 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DEPDC7Q96QD5 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
DEPDC7Q96QD5 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DEPDC7Q96QD5 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DEPDC7Q96QD5 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DEPDC7Q96QD5 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DEPDC7Q96QD5 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DEPDC7Q96QD5 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DEPDC7Q96QD5 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DEPDC7Q96QD5 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DEPDC7Q96QD5 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DEPDC7Q96QD5 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DEPDC7Q96QD5 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DEPDC7Q96QD5 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DEPDC7Q96QD5 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DEPDC7Q96QD5 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DEPDC7Q96QD5 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
DEPDC7Q96QD5 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DEPDC7Q96QD5 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DEPDC7Q96QD5 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DEPDC7Q96QD5 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DEPDC7Q96QD5 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DEPDC7Q96QD5 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DEPDC7Q96QD5 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DEPDC7Q96QD5 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms