Protein–RNA interactions for Protein: Q96NR8

RDH12, Retinol dehydrogenase 12, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH12Q96NR8 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RDH12Q96NR8 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RDH12Q96NR8 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RDH12Q96NR8 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RDH12Q96NR8 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RDH12Q96NR8 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RDH12Q96NR8 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RDH12Q96NR8 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RDH12Q96NR8 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RDH12Q96NR8 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RDH12Q96NR8 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RDH12Q96NR8 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RDH12Q96NR8 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RDH12Q96NR8 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RDH12Q96NR8 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RDH12Q96NR8 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RDH12Q96NR8 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RDH12Q96NR8 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RDH12Q96NR8 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RDH12Q96NR8 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RDH12Q96NR8 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RDH12Q96NR8 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RDH12Q96NR8 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RDH12Q96NR8 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RDH12Q96NR8 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RDH12Q96NR8 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RDH12Q96NR8 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RDH12Q96NR8 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RDH12Q96NR8 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RDH12Q96NR8 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RDH12Q96NR8 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RDH12Q96NR8 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RDH12Q96NR8 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RDH12Q96NR8 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RDH12Q96NR8 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RDH12Q96NR8 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RDH12Q96NR8 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RDH12Q96NR8 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RDH12Q96NR8 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RDH12Q96NR8 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RDH12Q96NR8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RDH12Q96NR8 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RDH12Q96NR8 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RDH12Q96NR8 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RDH12Q96NR8 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RDH12Q96NR8 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
RDH12Q96NR8 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RDH12Q96NR8 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
RDH12Q96NR8 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RDH12Q96NR8 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
RDH12Q96NR8 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RDH12Q96NR8 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RDH12Q96NR8 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RDH12Q96NR8 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RDH12Q96NR8 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RDH12Q96NR8 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RDH12Q96NR8 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RDH12Q96NR8 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RDH12Q96NR8 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RDH12Q96NR8 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RDH12Q96NR8 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
RDH12Q96NR8 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RDH12Q96NR8 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RDH12Q96NR8 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RDH12Q96NR8 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RDH12Q96NR8 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
RDH12Q96NR8 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RDH12Q96NR8 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RDH12Q96NR8 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RDH12Q96NR8 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RDH12Q96NR8 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RDH12Q96NR8 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RDH12Q96NR8 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RDH12Q96NR8 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RDH12Q96NR8 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RDH12Q96NR8 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RDH12Q96NR8 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RDH12Q96NR8 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RDH12Q96NR8 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RDH12Q96NR8 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RDH12Q96NR8 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RDH12Q96NR8 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RDH12Q96NR8 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RDH12Q96NR8 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
RDH12Q96NR8 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
RDH12Q96NR8 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RDH12Q96NR8 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RDH12Q96NR8 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RDH12Q96NR8 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RDH12Q96NR8 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RDH12Q96NR8 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RDH12Q96NR8 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RDH12Q96NR8 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RDH12Q96NR8 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RDH12Q96NR8 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RDH12Q96NR8 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
RDH12Q96NR8 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RDH12Q96NR8 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RDH12Q96NR8 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RDH12Q96NR8 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms