Protein–RNA interactions for Protein: Q96L91

EP400, E1A-binding protein p400, humanhuman

Predictions only

Length 3,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP400Q96L91 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
EP400Q96L91 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
EP400Q96L91 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
EP400Q96L91 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
EP400Q96L91 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
EP400Q96L91 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
EP400Q96L91 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
EP400Q96L91 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
EP400Q96L91 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
EP400Q96L91 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
EP400Q96L91 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
EP400Q96L91 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
EP400Q96L91 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
EP400Q96L91 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
EP400Q96L91 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
EP400Q96L91 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
EP400Q96L91 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
EP400Q96L91 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
EP400Q96L91 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
EP400Q96L91 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
EP400Q96L91 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC30.03■■■□□ 2.4
EP400Q96L91 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
EP400Q96L91 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
EP400Q96L91 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
EP400Q96L91 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
EP400Q96L91 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
EP400Q96L91 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
EP400Q96L91 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
EP400Q96L91 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
EP400Q96L91 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
EP400Q96L91 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
EP400Q96L91 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC30.02■■■□□ 2.4
EP400Q96L91 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.4
EP400Q96L91 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC30.01■■■□□ 2.4
EP400Q96L91 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC30.01■■■□□ 2.4
EP400Q96L91 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC30.01■■■□□ 2.39
EP400Q96L91 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
EP400Q96L91 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
EP400Q96L91 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
EP400Q96L91 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
EP400Q96L91 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
EP400Q96L91 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
EP400Q96L91 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
EP400Q96L91 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
EP400Q96L91 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
EP400Q96L91 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
EP400Q96L91 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
EP400Q96L91 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
EP400Q96L91 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
EP400Q96L91 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
EP400Q96L91 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
EP400Q96L91 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
EP400Q96L91 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
EP400Q96L91 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
EP400Q96L91 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
EP400Q96L91 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
EP400Q96L91 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC30■■■□□ 2.39
EP400Q96L91 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
EP400Q96L91 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
EP400Q96L91 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
EP400Q96L91 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
EP400Q96L91 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
EP400Q96L91 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
EP400Q96L91 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
EP400Q96L91 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
EP400Q96L91 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
EP400Q96L91 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
EP400Q96L91 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
EP400Q96L91 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
EP400Q96L91 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
EP400Q96L91 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
EP400Q96L91 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
EP400Q96L91 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
EP400Q96L91 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
EP400Q96L91 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
EP400Q96L91 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
EP400Q96L91 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
EP400Q96L91 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
EP400Q96L91 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
EP400Q96L91 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
EP400Q96L91 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
EP400Q96L91 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
EP400Q96L91 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
EP400Q96L91 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
EP400Q96L91 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
EP400Q96L91 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
EP400Q96L91 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
EP400Q96L91 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
EP400Q96L91 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
EP400Q96L91 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
EP400Q96L91 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC29.95■■■□□ 2.38
EP400Q96L91 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
EP400Q96L91 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
EP400Q96L91 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
EP400Q96L91 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
EP400Q96L91 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
EP400Q96L91 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
EP400Q96L91 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
EP400Q96L91 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
EP400Q96L91 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
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