Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN9

GJD4, Gap junction delta-4 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD4Q96KN9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
GJD4Q96KN9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
GJD4Q96KN9 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
GJD4Q96KN9 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
GJD4Q96KN9 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
GJD4Q96KN9 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
GJD4Q96KN9 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
GJD4Q96KN9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
GJD4Q96KN9 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
GJD4Q96KN9 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
GJD4Q96KN9 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
GJD4Q96KN9 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
GJD4Q96KN9 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
GJD4Q96KN9 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
GJD4Q96KN9 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
GJD4Q96KN9 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
GJD4Q96KN9 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
GJD4Q96KN9 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
GJD4Q96KN9 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
GJD4Q96KN9 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
GJD4Q96KN9 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
GJD4Q96KN9 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
GJD4Q96KN9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
GJD4Q96KN9 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
GJD4Q96KN9 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
GJD4Q96KN9 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
GJD4Q96KN9 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
GJD4Q96KN9 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
GJD4Q96KN9 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
GJD4Q96KN9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
GJD4Q96KN9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
GJD4Q96KN9 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
GJD4Q96KN9 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
GJD4Q96KN9 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
GJD4Q96KN9 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
GJD4Q96KN9 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
GJD4Q96KN9 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
GJD4Q96KN9 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
GJD4Q96KN9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
GJD4Q96KN9 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC30.33■■■□□ 2.45
GJD4Q96KN9 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
GJD4Q96KN9 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
GJD4Q96KN9 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
GJD4Q96KN9 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC30.32■■■□□ 2.44
GJD4Q96KN9 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
GJD4Q96KN9 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
GJD4Q96KN9 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
GJD4Q96KN9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
GJD4Q96KN9 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
GJD4Q96KN9 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
GJD4Q96KN9 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
GJD4Q96KN9 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
GJD4Q96KN9 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
GJD4Q96KN9 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
GJD4Q96KN9 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
GJD4Q96KN9 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC30.31■■■□□ 2.44
GJD4Q96KN9 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
GJD4Q96KN9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
GJD4Q96KN9 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
GJD4Q96KN9 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
GJD4Q96KN9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
GJD4Q96KN9 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
GJD4Q96KN9 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
GJD4Q96KN9 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
GJD4Q96KN9 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
GJD4Q96KN9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
GJD4Q96KN9 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
GJD4Q96KN9 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
GJD4Q96KN9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
GJD4Q96KN9 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
GJD4Q96KN9 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
GJD4Q96KN9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
GJD4Q96KN9 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
GJD4Q96KN9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
GJD4Q96KN9 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC30.28■■■□□ 2.44
GJD4Q96KN9 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
GJD4Q96KN9 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
GJD4Q96KN9 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
GJD4Q96KN9 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
GJD4Q96KN9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
GJD4Q96KN9 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
GJD4Q96KN9 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
GJD4Q96KN9 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
GJD4Q96KN9 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
GJD4Q96KN9 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
GJD4Q96KN9 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
GJD4Q96KN9 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
GJD4Q96KN9 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
GJD4Q96KN9 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
GJD4Q96KN9 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
GJD4Q96KN9 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
GJD4Q96KN9 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
GJD4Q96KN9 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
GJD4Q96KN9 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
GJD4Q96KN9 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
GJD4Q96KN9 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
GJD4Q96KN9 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.43
GJD4Q96KN9 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
GJD4Q96KN9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
GJD4Q96KN9 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms