Protein–RNA interactions for Protein: Q96K49

TMEM87B, Transmembrane protein 87B, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM87BQ96K49 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TMEM87BQ96K49 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TMEM87BQ96K49 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TMEM87BQ96K49 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TMEM87BQ96K49 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TMEM87BQ96K49 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TMEM87BQ96K49 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TMEM87BQ96K49 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TMEM87BQ96K49 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TMEM87BQ96K49 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TMEM87BQ96K49 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TMEM87BQ96K49 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TMEM87BQ96K49 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TMEM87BQ96K49 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TMEM87BQ96K49 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TMEM87BQ96K49 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TMEM87BQ96K49 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TMEM87BQ96K49 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TMEM87BQ96K49 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TMEM87BQ96K49 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TMEM87BQ96K49 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TMEM87BQ96K49 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TMEM87BQ96K49 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TMEM87BQ96K49 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TMEM87BQ96K49 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TMEM87BQ96K49 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
TMEM87BQ96K49 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
TMEM87BQ96K49 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
TMEM87BQ96K49 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
TMEM87BQ96K49 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TMEM87BQ96K49 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TMEM87BQ96K49 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TMEM87BQ96K49 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TMEM87BQ96K49 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TMEM87BQ96K49 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TMEM87BQ96K49 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TMEM87BQ96K49 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TMEM87BQ96K49 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TMEM87BQ96K49 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TMEM87BQ96K49 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
TMEM87BQ96K49 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TMEM87BQ96K49 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TMEM87BQ96K49 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TMEM87BQ96K49 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TMEM87BQ96K49 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TMEM87BQ96K49 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TMEM87BQ96K49 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TMEM87BQ96K49 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
TMEM87BQ96K49 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TMEM87BQ96K49 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TMEM87BQ96K49 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TMEM87BQ96K49 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TMEM87BQ96K49 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TMEM87BQ96K49 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TMEM87BQ96K49 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TMEM87BQ96K49 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TMEM87BQ96K49 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TMEM87BQ96K49 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TMEM87BQ96K49 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TMEM87BQ96K49 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TMEM87BQ96K49 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TMEM87BQ96K49 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TMEM87BQ96K49 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TMEM87BQ96K49 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TMEM87BQ96K49 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TMEM87BQ96K49 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TMEM87BQ96K49 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TMEM87BQ96K49 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TMEM87BQ96K49 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
TMEM87BQ96K49 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TMEM87BQ96K49 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TMEM87BQ96K49 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TMEM87BQ96K49 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TMEM87BQ96K49 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TMEM87BQ96K49 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TMEM87BQ96K49 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TMEM87BQ96K49 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TMEM87BQ96K49 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TMEM87BQ96K49 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TMEM87BQ96K49 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TMEM87BQ96K49 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TMEM87BQ96K49 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TMEM87BQ96K49 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TMEM87BQ96K49 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TMEM87BQ96K49 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TMEM87BQ96K49 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TMEM87BQ96K49 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TMEM87BQ96K49 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TMEM87BQ96K49 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TMEM87BQ96K49 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TMEM87BQ96K49 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TMEM87BQ96K49 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TMEM87BQ96K49 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TMEM87BQ96K49 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TMEM87BQ96K49 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TMEM87BQ96K49 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TMEM87BQ96K49 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TMEM87BQ96K49 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMEM87BQ96K49 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
TMEM87BQ96K49 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.6 ms