Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM3

CHAMP1, Chromosome alignment-maintaining phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAMP1Q96JM3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CHAMP1Q96JM3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CHAMP1Q96JM3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CHAMP1Q96JM3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CHAMP1Q96JM3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CHAMP1Q96JM3 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CHAMP1Q96JM3 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CHAMP1Q96JM3 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CHAMP1Q96JM3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CHAMP1Q96JM3 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CHAMP1Q96JM3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CHAMP1Q96JM3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CHAMP1Q96JM3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CHAMP1Q96JM3 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CHAMP1Q96JM3 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CHAMP1Q96JM3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CHAMP1Q96JM3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
CHAMP1Q96JM3 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CHAMP1Q96JM3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CHAMP1Q96JM3 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CHAMP1Q96JM3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CHAMP1Q96JM3 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CHAMP1Q96JM3 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CHAMP1Q96JM3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CHAMP1Q96JM3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CHAMP1Q96JM3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
CHAMP1Q96JM3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CHAMP1Q96JM3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CHAMP1Q96JM3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CHAMP1Q96JM3 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CHAMP1Q96JM3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CHAMP1Q96JM3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CHAMP1Q96JM3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
CHAMP1Q96JM3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CHAMP1Q96JM3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CHAMP1Q96JM3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CHAMP1Q96JM3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CHAMP1Q96JM3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CHAMP1Q96JM3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CHAMP1Q96JM3 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CHAMP1Q96JM3 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CHAMP1Q96JM3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CHAMP1Q96JM3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CHAMP1Q96JM3 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CHAMP1Q96JM3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CHAMP1Q96JM3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CHAMP1Q96JM3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
CHAMP1Q96JM3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CHAMP1Q96JM3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CHAMP1Q96JM3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CHAMP1Q96JM3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CHAMP1Q96JM3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CHAMP1Q96JM3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CHAMP1Q96JM3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CHAMP1Q96JM3 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CHAMP1Q96JM3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CHAMP1Q96JM3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CHAMP1Q96JM3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CHAMP1Q96JM3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CHAMP1Q96JM3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
CHAMP1Q96JM3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CHAMP1Q96JM3 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CHAMP1Q96JM3 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CHAMP1Q96JM3 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CHAMP1Q96JM3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
CHAMP1Q96JM3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CHAMP1Q96JM3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CHAMP1Q96JM3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CHAMP1Q96JM3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CHAMP1Q96JM3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CHAMP1Q96JM3 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CHAMP1Q96JM3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CHAMP1Q96JM3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CHAMP1Q96JM3 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CHAMP1Q96JM3 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CHAMP1Q96JM3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CHAMP1Q96JM3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CHAMP1Q96JM3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CHAMP1Q96JM3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CHAMP1Q96JM3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CHAMP1Q96JM3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CHAMP1Q96JM3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
CHAMP1Q96JM3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CHAMP1Q96JM3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CHAMP1Q96JM3 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CHAMP1Q96JM3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CHAMP1Q96JM3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CHAMP1Q96JM3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CHAMP1Q96JM3 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CHAMP1Q96JM3 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CHAMP1Q96JM3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
CHAMP1Q96JM3 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CHAMP1Q96JM3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CHAMP1Q96JM3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CHAMP1Q96JM3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
CHAMP1Q96JM3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CHAMP1Q96JM3 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CHAMP1Q96JM3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CHAMP1Q96JM3 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CHAMP1Q96JM3 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms