Protein–RNA interactions for Protein: Q96H20

SNF8, Vacuolar-sorting protein SNF8, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNF8Q96H20 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNF8Q96H20 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNF8Q96H20 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNF8Q96H20 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SNF8Q96H20 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNF8Q96H20 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNF8Q96H20 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNF8Q96H20 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNF8Q96H20 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNF8Q96H20 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNF8Q96H20 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNF8Q96H20 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNF8Q96H20 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNF8Q96H20 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNF8Q96H20 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SNF8Q96H20 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNF8Q96H20 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SNF8Q96H20 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNF8Q96H20 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNF8Q96H20 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNF8Q96H20 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNF8Q96H20 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNF8Q96H20 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNF8Q96H20 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SNF8Q96H20 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNF8Q96H20 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNF8Q96H20 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNF8Q96H20 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNF8Q96H20 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNF8Q96H20 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNF8Q96H20 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNF8Q96H20 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNF8Q96H20 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNF8Q96H20 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNF8Q96H20 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNF8Q96H20 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNF8Q96H20 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SNF8Q96H20 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNF8Q96H20 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNF8Q96H20 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNF8Q96H20 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNF8Q96H20 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNF8Q96H20 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNF8Q96H20 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNF8Q96H20 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNF8Q96H20 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNF8Q96H20 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNF8Q96H20 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNF8Q96H20 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNF8Q96H20 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNF8Q96H20 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNF8Q96H20 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNF8Q96H20 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNF8Q96H20 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNF8Q96H20 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNF8Q96H20 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNF8Q96H20 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNF8Q96H20 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNF8Q96H20 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNF8Q96H20 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNF8Q96H20 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNF8Q96H20 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNF8Q96H20 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNF8Q96H20 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNF8Q96H20 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNF8Q96H20 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNF8Q96H20 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SNF8Q96H20 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNF8Q96H20 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNF8Q96H20 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNF8Q96H20 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNF8Q96H20 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNF8Q96H20 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNF8Q96H20 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNF8Q96H20 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNF8Q96H20 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SNF8Q96H20 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNF8Q96H20 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNF8Q96H20 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNF8Q96H20 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNF8Q96H20 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNF8Q96H20 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNF8Q96H20 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNF8Q96H20 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNF8Q96H20 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNF8Q96H20 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNF8Q96H20 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNF8Q96H20 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNF8Q96H20 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNF8Q96H20 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SNF8Q96H20 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNF8Q96H20 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNF8Q96H20 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNF8Q96H20 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNF8Q96H20 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNF8Q96H20 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNF8Q96H20 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNF8Q96H20 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNF8Q96H20 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNF8Q96H20 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms