Protein–RNA interactions for Protein: Q96GM5

SMARCD1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD1Q96GM5 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMARCD1Q96GM5 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMARCD1Q96GM5 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMARCD1Q96GM5 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SMARCD1Q96GM5 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMARCD1Q96GM5 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMARCD1Q96GM5 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMARCD1Q96GM5 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMARCD1Q96GM5 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SMARCD1Q96GM5 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SMARCD1Q96GM5 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMARCD1Q96GM5 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMARCD1Q96GM5 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMARCD1Q96GM5 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMARCD1Q96GM5 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMARCD1Q96GM5 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMARCD1Q96GM5 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMARCD1Q96GM5 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMARCD1Q96GM5 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMARCD1Q96GM5 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMARCD1Q96GM5 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMARCD1Q96GM5 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMARCD1Q96GM5 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMARCD1Q96GM5 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMARCD1Q96GM5 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMARCD1Q96GM5 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMARCD1Q96GM5 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMARCD1Q96GM5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMARCD1Q96GM5 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMARCD1Q96GM5 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMARCD1Q96GM5 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMARCD1Q96GM5 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMARCD1Q96GM5 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMARCD1Q96GM5 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMARCD1Q96GM5 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMARCD1Q96GM5 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMARCD1Q96GM5 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMARCD1Q96GM5 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMARCD1Q96GM5 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMARCD1Q96GM5 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMARCD1Q96GM5 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMARCD1Q96GM5 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SMARCD1Q96GM5 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMARCD1Q96GM5 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMARCD1Q96GM5 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMARCD1Q96GM5 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMARCD1Q96GM5 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMARCD1Q96GM5 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMARCD1Q96GM5 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMARCD1Q96GM5 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMARCD1Q96GM5 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMARCD1Q96GM5 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMARCD1Q96GM5 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMARCD1Q96GM5 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMARCD1Q96GM5 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMARCD1Q96GM5 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMARCD1Q96GM5 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMARCD1Q96GM5 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMARCD1Q96GM5 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMARCD1Q96GM5 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMARCD1Q96GM5 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMARCD1Q96GM5 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SMARCD1Q96GM5 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMARCD1Q96GM5 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMARCD1Q96GM5 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMARCD1Q96GM5 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMARCD1Q96GM5 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMARCD1Q96GM5 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMARCD1Q96GM5 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMARCD1Q96GM5 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMARCD1Q96GM5 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMARCD1Q96GM5 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMARCD1Q96GM5 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMARCD1Q96GM5 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMARCD1Q96GM5 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SMARCD1Q96GM5 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMARCD1Q96GM5 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMARCD1Q96GM5 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMARCD1Q96GM5 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMARCD1Q96GM5 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMARCD1Q96GM5 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMARCD1Q96GM5 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMARCD1Q96GM5 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMARCD1Q96GM5 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMARCD1Q96GM5 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMARCD1Q96GM5 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMARCD1Q96GM5 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMARCD1Q96GM5 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMARCD1Q96GM5 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMARCD1Q96GM5 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMARCD1Q96GM5 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMARCD1Q96GM5 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMARCD1Q96GM5 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMARCD1Q96GM5 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMARCD1Q96GM5 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMARCD1Q96GM5 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SMARCD1Q96GM5 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMARCD1Q96GM5 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMARCD1Q96GM5 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMARCD1Q96GM5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms