Protein–RNA interactions for Protein: Q96GD0

PDXP, Pyridoxal phosphate phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDXPQ96GD0 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDXPQ96GD0 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDXPQ96GD0 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDXPQ96GD0 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDXPQ96GD0 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDXPQ96GD0 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDXPQ96GD0 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDXPQ96GD0 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PDXPQ96GD0 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDXPQ96GD0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDXPQ96GD0 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDXPQ96GD0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDXPQ96GD0 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDXPQ96GD0 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDXPQ96GD0 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDXPQ96GD0 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDXPQ96GD0 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDXPQ96GD0 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDXPQ96GD0 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDXPQ96GD0 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDXPQ96GD0 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDXPQ96GD0 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDXPQ96GD0 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDXPQ96GD0 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDXPQ96GD0 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDXPQ96GD0 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDXPQ96GD0 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PDXPQ96GD0 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDXPQ96GD0 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDXPQ96GD0 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDXPQ96GD0 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDXPQ96GD0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDXPQ96GD0 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDXPQ96GD0 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDXPQ96GD0 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDXPQ96GD0 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDXPQ96GD0 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDXPQ96GD0 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PDXPQ96GD0 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDXPQ96GD0 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDXPQ96GD0 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDXPQ96GD0 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDXPQ96GD0 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDXPQ96GD0 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDXPQ96GD0 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDXPQ96GD0 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDXPQ96GD0 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDXPQ96GD0 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDXPQ96GD0 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDXPQ96GD0 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDXPQ96GD0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDXPQ96GD0 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDXPQ96GD0 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDXPQ96GD0 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDXPQ96GD0 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDXPQ96GD0 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDXPQ96GD0 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PDXPQ96GD0 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDXPQ96GD0 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PDXPQ96GD0 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PDXPQ96GD0 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
PDXPQ96GD0 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PDXPQ96GD0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDXPQ96GD0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDXPQ96GD0 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDXPQ96GD0 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDXPQ96GD0 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDXPQ96GD0 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PDXPQ96GD0 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDXPQ96GD0 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PDXPQ96GD0 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PDXPQ96GD0 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDXPQ96GD0 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDXPQ96GD0 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDXPQ96GD0 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDXPQ96GD0 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDXPQ96GD0 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PDXPQ96GD0 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDXPQ96GD0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDXPQ96GD0 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDXPQ96GD0 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDXPQ96GD0 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDXPQ96GD0 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PDXPQ96GD0 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PDXPQ96GD0 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDXPQ96GD0 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDXPQ96GD0 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDXPQ96GD0 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDXPQ96GD0 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDXPQ96GD0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDXPQ96GD0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDXPQ96GD0 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDXPQ96GD0 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDXPQ96GD0 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PDXPQ96GD0 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDXPQ96GD0 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDXPQ96GD0 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDXPQ96GD0 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDXPQ96GD0 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDXPQ96GD0 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms