Protein–RNA interactions for Protein: Q96FS4

SIPA1, Signal-induced proliferation-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIPA1Q96FS4 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SIPA1Q96FS4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SIPA1Q96FS4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SIPA1Q96FS4 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SIPA1Q96FS4 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SIPA1Q96FS4 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SIPA1Q96FS4 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SIPA1Q96FS4 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SIPA1Q96FS4 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SIPA1Q96FS4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SIPA1Q96FS4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SIPA1Q96FS4 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SIPA1Q96FS4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SIPA1Q96FS4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SIPA1Q96FS4 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SIPA1Q96FS4 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SIPA1Q96FS4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SIPA1Q96FS4 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SIPA1Q96FS4 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SIPA1Q96FS4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SIPA1Q96FS4 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SIPA1Q96FS4 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SIPA1Q96FS4 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SIPA1Q96FS4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SIPA1Q96FS4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SIPA1Q96FS4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SIPA1Q96FS4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SIPA1Q96FS4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SIPA1Q96FS4 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SIPA1Q96FS4 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SIPA1Q96FS4 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SIPA1Q96FS4 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SIPA1Q96FS4 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SIPA1Q96FS4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SIPA1Q96FS4 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SIPA1Q96FS4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SIPA1Q96FS4 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SIPA1Q96FS4 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SIPA1Q96FS4 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SIPA1Q96FS4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SIPA1Q96FS4 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SIPA1Q96FS4 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SIPA1Q96FS4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SIPA1Q96FS4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIPA1Q96FS4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIPA1Q96FS4 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIPA1Q96FS4 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIPA1Q96FS4 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIPA1Q96FS4 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIPA1Q96FS4 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIPA1Q96FS4 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIPA1Q96FS4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIPA1Q96FS4 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIPA1Q96FS4 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIPA1Q96FS4 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIPA1Q96FS4 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIPA1Q96FS4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIPA1Q96FS4 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIPA1Q96FS4 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIPA1Q96FS4 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SIPA1Q96FS4 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIPA1Q96FS4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIPA1Q96FS4 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIPA1Q96FS4 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIPA1Q96FS4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SIPA1Q96FS4 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIPA1Q96FS4 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIPA1Q96FS4 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIPA1Q96FS4 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIPA1Q96FS4 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIPA1Q96FS4 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIPA1Q96FS4 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIPA1Q96FS4 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIPA1Q96FS4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIPA1Q96FS4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIPA1Q96FS4 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIPA1Q96FS4 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIPA1Q96FS4 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIPA1Q96FS4 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIPA1Q96FS4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIPA1Q96FS4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIPA1Q96FS4 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIPA1Q96FS4 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIPA1Q96FS4 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIPA1Q96FS4 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIPA1Q96FS4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIPA1Q96FS4 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIPA1Q96FS4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SIPA1Q96FS4 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIPA1Q96FS4 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIPA1Q96FS4 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SIPA1Q96FS4 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIPA1Q96FS4 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIPA1Q96FS4 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIPA1Q96FS4 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIPA1Q96FS4 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SIPA1Q96FS4 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SIPA1Q96FS4 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIPA1Q96FS4 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SIPA1Q96FS4 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms