Protein–RNA interactions for Protein: Q96F85

CNRIP1, CB1 cannabinoid receptor-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 164 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNRIP1Q96F85 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNRIP1Q96F85 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNRIP1Q96F85 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNRIP1Q96F85 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNRIP1Q96F85 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNRIP1Q96F85 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNRIP1Q96F85 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNRIP1Q96F85 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNRIP1Q96F85 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNRIP1Q96F85 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNRIP1Q96F85 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNRIP1Q96F85 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNRIP1Q96F85 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNRIP1Q96F85 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNRIP1Q96F85 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CNRIP1Q96F85 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNRIP1Q96F85 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNRIP1Q96F85 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNRIP1Q96F85 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNRIP1Q96F85 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNRIP1Q96F85 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNRIP1Q96F85 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNRIP1Q96F85 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNRIP1Q96F85 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNRIP1Q96F85 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNRIP1Q96F85 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNRIP1Q96F85 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNRIP1Q96F85 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNRIP1Q96F85 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNRIP1Q96F85 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CNRIP1Q96F85 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CNRIP1Q96F85 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CNRIP1Q96F85 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CNRIP1Q96F85 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CNRIP1Q96F85 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CNRIP1Q96F85 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CNRIP1Q96F85 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CNRIP1Q96F85 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CNRIP1Q96F85 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CNRIP1Q96F85 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CNRIP1Q96F85 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CNRIP1Q96F85 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CNRIP1Q96F85 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CNRIP1Q96F85 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CNRIP1Q96F85 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CNRIP1Q96F85 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CNRIP1Q96F85 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CNRIP1Q96F85 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CNRIP1Q96F85 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CNRIP1Q96F85 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CNRIP1Q96F85 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CNRIP1Q96F85 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CNRIP1Q96F85 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CNRIP1Q96F85 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CNRIP1Q96F85 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CNRIP1Q96F85 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CNRIP1Q96F85 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CNRIP1Q96F85 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CNRIP1Q96F85 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CNRIP1Q96F85 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CNRIP1Q96F85 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CNRIP1Q96F85 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNRIP1Q96F85 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CNRIP1Q96F85 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CNRIP1Q96F85 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CNRIP1Q96F85 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNRIP1Q96F85 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CNRIP1Q96F85 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNRIP1Q96F85 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CNRIP1Q96F85 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNRIP1Q96F85 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNRIP1Q96F85 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CNRIP1Q96F85 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CNRIP1Q96F85 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CNRIP1Q96F85 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNRIP1Q96F85 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNRIP1Q96F85 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CNRIP1Q96F85 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
CNRIP1Q96F85 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNRIP1Q96F85 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CNRIP1Q96F85 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CNRIP1Q96F85 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CNRIP1Q96F85 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CNRIP1Q96F85 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CNRIP1Q96F85 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CNRIP1Q96F85 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CNRIP1Q96F85 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CNRIP1Q96F85 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CNRIP1Q96F85 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CNRIP1Q96F85 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CNRIP1Q96F85 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CNRIP1Q96F85 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CNRIP1Q96F85 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CNRIP1Q96F85 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CNRIP1Q96F85 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CNRIP1Q96F85 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNRIP1Q96F85 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNRIP1Q96F85 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNRIP1Q96F85 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNRIP1Q96F85 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms