Protein–RNA interactions for Protein: Q96EU6

RRP36, Ribosomal RNA processing protein 36 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP36Q96EU6 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RRP36Q96EU6 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RRP36Q96EU6 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
RRP36Q96EU6 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RRP36Q96EU6 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RRP36Q96EU6 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RRP36Q96EU6 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RRP36Q96EU6 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
RRP36Q96EU6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RRP36Q96EU6 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RRP36Q96EU6 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RRP36Q96EU6 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RRP36Q96EU6 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RRP36Q96EU6 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RRP36Q96EU6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RRP36Q96EU6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RRP36Q96EU6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RRP36Q96EU6 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RRP36Q96EU6 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RRP36Q96EU6 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RRP36Q96EU6 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RRP36Q96EU6 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RRP36Q96EU6 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RRP36Q96EU6 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RRP36Q96EU6 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RRP36Q96EU6 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RRP36Q96EU6 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RRP36Q96EU6 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RRP36Q96EU6 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RRP36Q96EU6 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RRP36Q96EU6 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RRP36Q96EU6 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RRP36Q96EU6 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RRP36Q96EU6 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
RRP36Q96EU6 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RRP36Q96EU6 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RRP36Q96EU6 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
RRP36Q96EU6 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RRP36Q96EU6 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RRP36Q96EU6 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RRP36Q96EU6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RRP36Q96EU6 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RRP36Q96EU6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RRP36Q96EU6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
RRP36Q96EU6 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
RRP36Q96EU6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
RRP36Q96EU6 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
RRP36Q96EU6 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RRP36Q96EU6 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RRP36Q96EU6 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RRP36Q96EU6 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RRP36Q96EU6 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RRP36Q96EU6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RRP36Q96EU6 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
RRP36Q96EU6 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RRP36Q96EU6 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RRP36Q96EU6 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RRP36Q96EU6 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RRP36Q96EU6 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RRP36Q96EU6 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
RRP36Q96EU6 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RRP36Q96EU6 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RRP36Q96EU6 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RRP36Q96EU6 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RRP36Q96EU6 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RRP36Q96EU6 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RRP36Q96EU6 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RRP36Q96EU6 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RRP36Q96EU6 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RRP36Q96EU6 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RRP36Q96EU6 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RRP36Q96EU6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RRP36Q96EU6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RRP36Q96EU6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RRP36Q96EU6 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RRP36Q96EU6 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RRP36Q96EU6 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RRP36Q96EU6 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RRP36Q96EU6 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RRP36Q96EU6 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RRP36Q96EU6 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RRP36Q96EU6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RRP36Q96EU6 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RRP36Q96EU6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RRP36Q96EU6 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RRP36Q96EU6 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RRP36Q96EU6 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RRP36Q96EU6 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RRP36Q96EU6 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RRP36Q96EU6 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RRP36Q96EU6 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RRP36Q96EU6 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RRP36Q96EU6 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
RRP36Q96EU6 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RRP36Q96EU6 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RRP36Q96EU6 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
RRP36Q96EU6 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RRP36Q96EU6 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RRP36Q96EU6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RRP36Q96EU6 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms