Protein–RNA interactions for Protein: Q96E16

SMIM19, Small integral membrane protein 19, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM19Q96E16 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMIM19Q96E16 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMIM19Q96E16 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMIM19Q96E16 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SMIM19Q96E16 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMIM19Q96E16 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMIM19Q96E16 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMIM19Q96E16 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMIM19Q96E16 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMIM19Q96E16 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMIM19Q96E16 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMIM19Q96E16 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMIM19Q96E16 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMIM19Q96E16 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMIM19Q96E16 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMIM19Q96E16 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMIM19Q96E16 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMIM19Q96E16 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMIM19Q96E16 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMIM19Q96E16 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMIM19Q96E16 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMIM19Q96E16 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMIM19Q96E16 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMIM19Q96E16 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMIM19Q96E16 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMIM19Q96E16 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMIM19Q96E16 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMIM19Q96E16 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMIM19Q96E16 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMIM19Q96E16 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMIM19Q96E16 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMIM19Q96E16 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMIM19Q96E16 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMIM19Q96E16 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMIM19Q96E16 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SMIM19Q96E16 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMIM19Q96E16 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMIM19Q96E16 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMIM19Q96E16 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMIM19Q96E16 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMIM19Q96E16 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMIM19Q96E16 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMIM19Q96E16 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMIM19Q96E16 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMIM19Q96E16 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMIM19Q96E16 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMIM19Q96E16 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMIM19Q96E16 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMIM19Q96E16 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMIM19Q96E16 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMIM19Q96E16 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SMIM19Q96E16 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMIM19Q96E16 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMIM19Q96E16 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMIM19Q96E16 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMIM19Q96E16 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMIM19Q96E16 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMIM19Q96E16 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMIM19Q96E16 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMIM19Q96E16 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
SMIM19Q96E16 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMIM19Q96E16 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMIM19Q96E16 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMIM19Q96E16 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMIM19Q96E16 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMIM19Q96E16 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMIM19Q96E16 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMIM19Q96E16 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMIM19Q96E16 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMIM19Q96E16 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMIM19Q96E16 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMIM19Q96E16 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMIM19Q96E16 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMIM19Q96E16 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMIM19Q96E16 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMIM19Q96E16 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMIM19Q96E16 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMIM19Q96E16 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMIM19Q96E16 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMIM19Q96E16 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMIM19Q96E16 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMIM19Q96E16 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SMIM19Q96E16 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SMIM19Q96E16 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SMIM19Q96E16 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SMIM19Q96E16 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SMIM19Q96E16 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SMIM19Q96E16 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SMIM19Q96E16 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SMIM19Q96E16 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SMIM19Q96E16 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SMIM19Q96E16 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SMIM19Q96E16 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SMIM19Q96E16 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
SMIM19Q96E16 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMIM19Q96E16 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMIM19Q96E16 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMIM19Q96E16 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMIM19Q96E16 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMIM19Q96E16 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms