Protein–RNA interactions for Protein: Q96AQ1

CCDC74A, Coiled-coil domain-containing protein 74A, humanhuman

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Length 378 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC74AQ96AQ1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC74AQ96AQ1 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC74AQ96AQ1 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC74AQ96AQ1 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC74AQ96AQ1 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC74AQ96AQ1 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC74AQ96AQ1 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC74AQ96AQ1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC74AQ96AQ1 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC74AQ96AQ1 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC74AQ96AQ1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC74AQ96AQ1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC74AQ96AQ1 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC74AQ96AQ1 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC74AQ96AQ1 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC74AQ96AQ1 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC74AQ96AQ1 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC74AQ96AQ1 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC74AQ96AQ1 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC74AQ96AQ1 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC74AQ96AQ1 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC74AQ96AQ1 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC74AQ96AQ1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC74AQ96AQ1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC74AQ96AQ1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC74AQ96AQ1 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC74AQ96AQ1 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC74AQ96AQ1 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC74AQ96AQ1 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC74AQ96AQ1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC74AQ96AQ1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC74AQ96AQ1 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC74AQ96AQ1 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC74AQ96AQ1 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC74AQ96AQ1 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC74AQ96AQ1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC74AQ96AQ1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC74AQ96AQ1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC74AQ96AQ1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC74AQ96AQ1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC74AQ96AQ1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC74AQ96AQ1 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC74AQ96AQ1 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC74AQ96AQ1 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC74AQ96AQ1 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC74AQ96AQ1 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC74AQ96AQ1 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC74AQ96AQ1 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC74AQ96AQ1 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC74AQ96AQ1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC74AQ96AQ1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC74AQ96AQ1 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC74AQ96AQ1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC74AQ96AQ1 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC74AQ96AQ1 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC74AQ96AQ1 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC74AQ96AQ1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC74AQ96AQ1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC74AQ96AQ1 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC74AQ96AQ1 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC74AQ96AQ1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC74AQ96AQ1 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC74AQ96AQ1 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC74AQ96AQ1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC74AQ96AQ1 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC74AQ96AQ1 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC74AQ96AQ1 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC74AQ96AQ1 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC74AQ96AQ1 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC74AQ96AQ1 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC74AQ96AQ1 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC74AQ96AQ1 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC74AQ96AQ1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC74AQ96AQ1 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC74AQ96AQ1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC74AQ96AQ1 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC74AQ96AQ1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC74AQ96AQ1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC74AQ96AQ1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC74AQ96AQ1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC74AQ96AQ1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC74AQ96AQ1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC74AQ96AQ1 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC74AQ96AQ1 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC74AQ96AQ1 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC74AQ96AQ1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC74AQ96AQ1 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC74AQ96AQ1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC74AQ96AQ1 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC74AQ96AQ1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC74AQ96AQ1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC74AQ96AQ1 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC74AQ96AQ1 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC74AQ96AQ1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC74AQ96AQ1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC74AQ96AQ1 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC74AQ96AQ1 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC74AQ96AQ1 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC74AQ96AQ1 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC74AQ96AQ1 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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