Protein–RNA interactions for Protein: Q96A29

SLC35C1, GDP-fucose transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35C1Q96A29 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC35C1Q96A29 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC35C1Q96A29 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC35C1Q96A29 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC35C1Q96A29 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC35C1Q96A29 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC35C1Q96A29 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC35C1Q96A29 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC35C1Q96A29 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC35C1Q96A29 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC35C1Q96A29 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC35C1Q96A29 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC35C1Q96A29 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC35C1Q96A29 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC35C1Q96A29 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC35C1Q96A29 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC35C1Q96A29 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC35C1Q96A29 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC35C1Q96A29 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC35C1Q96A29 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC35C1Q96A29 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC35C1Q96A29 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC35C1Q96A29 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC35C1Q96A29 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC35C1Q96A29 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC35C1Q96A29 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC35C1Q96A29 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC35C1Q96A29 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC35C1Q96A29 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC35C1Q96A29 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC35C1Q96A29 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC35C1Q96A29 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC35C1Q96A29 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC35C1Q96A29 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC35C1Q96A29 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC35C1Q96A29 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC35C1Q96A29 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC35C1Q96A29 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC35C1Q96A29 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC35C1Q96A29 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC35C1Q96A29 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC35C1Q96A29 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC35C1Q96A29 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC35C1Q96A29 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC35C1Q96A29 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC35C1Q96A29 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC35C1Q96A29 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC35C1Q96A29 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC35C1Q96A29 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC35C1Q96A29 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC35C1Q96A29 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC35C1Q96A29 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC35C1Q96A29 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC35C1Q96A29 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC35C1Q96A29 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC35C1Q96A29 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC35C1Q96A29 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC35C1Q96A29 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC35C1Q96A29 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC35C1Q96A29 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC35C1Q96A29 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC35C1Q96A29 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC35C1Q96A29 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC35C1Q96A29 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC35C1Q96A29 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC35C1Q96A29 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC35C1Q96A29 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC35C1Q96A29 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC35C1Q96A29 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC35C1Q96A29 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC35C1Q96A29 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC35C1Q96A29 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC35C1Q96A29 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC35C1Q96A29 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC35C1Q96A29 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC35C1Q96A29 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC35C1Q96A29 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC35C1Q96A29 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC35C1Q96A29 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC35C1Q96A29 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC35C1Q96A29 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC35C1Q96A29 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC35C1Q96A29 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC35C1Q96A29 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC35C1Q96A29 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC35C1Q96A29 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC35C1Q96A29 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC35C1Q96A29 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC35C1Q96A29 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC35C1Q96A29 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC35C1Q96A29 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC35C1Q96A29 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC35C1Q96A29 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC35C1Q96A29 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC35C1Q96A29 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC35C1Q96A29 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SLC35C1Q96A29 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SLC35C1Q96A29 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC35C1Q96A29 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC35C1Q96A29 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms