Protein–RNA interactions for Protein: Q92889

ERCC4, DNA repair endonuclease XPF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC4Q92889 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ERCC4Q92889 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ERCC4Q92889 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ERCC4Q92889 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ERCC4Q92889 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ERCC4Q92889 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ERCC4Q92889 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ERCC4Q92889 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ERCC4Q92889 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ERCC4Q92889 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
ERCC4Q92889 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ERCC4Q92889 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ERCC4Q92889 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ERCC4Q92889 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
ERCC4Q92889 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ERCC4Q92889 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ERCC4Q92889 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ERCC4Q92889 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
ERCC4Q92889 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ERCC4Q92889 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ERCC4Q92889 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ERCC4Q92889 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ERCC4Q92889 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ERCC4Q92889 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ERCC4Q92889 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ERCC4Q92889 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ERCC4Q92889 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
ERCC4Q92889 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ERCC4Q92889 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ERCC4Q92889 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ERCC4Q92889 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ERCC4Q92889 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ERCC4Q92889 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ERCC4Q92889 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
ERCC4Q92889 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ERCC4Q92889 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ERCC4Q92889 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ERCC4Q92889 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ERCC4Q92889 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ERCC4Q92889 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ERCC4Q92889 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
ERCC4Q92889 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ERCC4Q92889 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ERCC4Q92889 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ERCC4Q92889 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ERCC4Q92889 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ERCC4Q92889 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
ERCC4Q92889 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
ERCC4Q92889 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ERCC4Q92889 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ERCC4Q92889 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ERCC4Q92889 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ERCC4Q92889 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ERCC4Q92889 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ERCC4Q92889 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ERCC4Q92889 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ERCC4Q92889 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ERCC4Q92889 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ERCC4Q92889 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ERCC4Q92889 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ERCC4Q92889 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ERCC4Q92889 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ERCC4Q92889 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ERCC4Q92889 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ERCC4Q92889 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ERCC4Q92889 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ERCC4Q92889 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
ERCC4Q92889 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
ERCC4Q92889 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
ERCC4Q92889 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ERCC4Q92889 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ERCC4Q92889 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ERCC4Q92889 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ERCC4Q92889 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ERCC4Q92889 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ERCC4Q92889 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ERCC4Q92889 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ERCC4Q92889 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ERCC4Q92889 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
ERCC4Q92889 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ERCC4Q92889 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ERCC4Q92889 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ERCC4Q92889 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ERCC4Q92889 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ERCC4Q92889 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ERCC4Q92889 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ERCC4Q92889 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ERCC4Q92889 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ERCC4Q92889 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ERCC4Q92889 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ERCC4Q92889 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ERCC4Q92889 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
ERCC4Q92889 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ERCC4Q92889 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
ERCC4Q92889 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ERCC4Q92889 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
ERCC4Q92889 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ERCC4Q92889 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ERCC4Q92889 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ERCC4Q92889 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms