Protein–RNA interactions for Protein: Q92772

CDKL2, Cyclin-dependent kinase-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL2Q92772 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CDKL2Q92772 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CDKL2Q92772 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CDKL2Q92772 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CDKL2Q92772 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDKL2Q92772 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDKL2Q92772 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDKL2Q92772 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDKL2Q92772 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDKL2Q92772 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDKL2Q92772 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDKL2Q92772 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDKL2Q92772 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDKL2Q92772 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDKL2Q92772 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDKL2Q92772 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDKL2Q92772 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDKL2Q92772 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDKL2Q92772 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDKL2Q92772 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDKL2Q92772 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDKL2Q92772 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDKL2Q92772 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDKL2Q92772 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDKL2Q92772 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDKL2Q92772 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CDKL2Q92772 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDKL2Q92772 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDKL2Q92772 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDKL2Q92772 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDKL2Q92772 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDKL2Q92772 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDKL2Q92772 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDKL2Q92772 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDKL2Q92772 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDKL2Q92772 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDKL2Q92772 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDKL2Q92772 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDKL2Q92772 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDKL2Q92772 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDKL2Q92772 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDKL2Q92772 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CDKL2Q92772 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDKL2Q92772 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDKL2Q92772 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDKL2Q92772 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDKL2Q92772 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDKL2Q92772 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDKL2Q92772 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDKL2Q92772 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDKL2Q92772 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDKL2Q92772 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDKL2Q92772 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDKL2Q92772 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDKL2Q92772 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDKL2Q92772 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDKL2Q92772 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDKL2Q92772 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDKL2Q92772 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDKL2Q92772 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDKL2Q92772 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDKL2Q92772 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDKL2Q92772 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDKL2Q92772 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDKL2Q92772 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDKL2Q92772 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDKL2Q92772 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDKL2Q92772 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CDKL2Q92772 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDKL2Q92772 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDKL2Q92772 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDKL2Q92772 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CDKL2Q92772 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDKL2Q92772 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CDKL2Q92772 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDKL2Q92772 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDKL2Q92772 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDKL2Q92772 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDKL2Q92772 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDKL2Q92772 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDKL2Q92772 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CDKL2Q92772 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDKL2Q92772 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDKL2Q92772 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDKL2Q92772 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDKL2Q92772 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDKL2Q92772 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDKL2Q92772 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDKL2Q92772 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDKL2Q92772 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CDKL2Q92772 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDKL2Q92772 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDKL2Q92772 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDKL2Q92772 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDKL2Q92772 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDKL2Q92772 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDKL2Q92772 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDKL2Q92772 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDKL2Q92772 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDKL2Q92772 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104 ms