Protein–RNA interactions for Protein: Q92752

TNR, Tenascin-R, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRQ92752 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
TNRQ92752 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
TNRQ92752 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
TNRQ92752 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
TNRQ92752 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
TNRQ92752 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC33.21■■■□□ 2.91
TNRQ92752 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
TNRQ92752 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
TNRQ92752 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
TNRQ92752 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
TNRQ92752 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
TNRQ92752 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
TNRQ92752 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
TNRQ92752 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC33.19■■■□□ 2.9
TNRQ92752 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
TNRQ92752 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
TNRQ92752 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
TNRQ92752 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
TNRQ92752 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
TNRQ92752 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
TNRQ92752 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC33.18■■■□□ 2.9
TNRQ92752 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
TNRQ92752 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
TNRQ92752 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
TNRQ92752 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
TNRQ92752 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
TNRQ92752 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
TNRQ92752 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
TNRQ92752 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
TNRQ92752 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
TNRQ92752 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
TNRQ92752 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
TNRQ92752 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
TNRQ92752 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
TNRQ92752 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
TNRQ92752 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
TNRQ92752 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
TNRQ92752 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
TNRQ92752 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
TNRQ92752 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
TNRQ92752 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
TNRQ92752 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
TNRQ92752 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
TNRQ92752 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
TNRQ92752 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
TNRQ92752 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
TNRQ92752 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
TNRQ92752 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
TNRQ92752 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
TNRQ92752 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
TNRQ92752 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
TNRQ92752 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
TNRQ92752 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
TNRQ92752 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
TNRQ92752 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
TNRQ92752 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
TNRQ92752 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
TNRQ92752 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
TNRQ92752 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
TNRQ92752 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
TNRQ92752 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
TNRQ92752 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
TNRQ92752 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC33.12■■■□□ 2.89
TNRQ92752 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
TNRQ92752 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
TNRQ92752 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
TNRQ92752 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
TNRQ92752 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
TNRQ92752 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
TNRQ92752 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
TNRQ92752 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
TNRQ92752 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
TNRQ92752 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
TNRQ92752 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
TNRQ92752 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
TNRQ92752 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
TNRQ92752 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
TNRQ92752 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
TNRQ92752 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
TNRQ92752 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
TNRQ92752 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
TNRQ92752 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
TNRQ92752 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
TNRQ92752 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
TNRQ92752 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
TNRQ92752 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
TNRQ92752 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
TNRQ92752 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
TNRQ92752 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
TNRQ92752 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
TNRQ92752 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
TNRQ92752 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC33.08■■■□□ 2.89
TNRQ92752 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
TNRQ92752 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
TNRQ92752 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
TNRQ92752 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.89
TNRQ92752 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
TNRQ92752 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
TNRQ92752 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
TNRQ92752 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms