Protein–RNA interactions for Protein: Q92750

TAF4B, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF4BQ92750 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TAF4BQ92750 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TAF4BQ92750 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TAF4BQ92750 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TAF4BQ92750 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TAF4BQ92750 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TAF4BQ92750 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TAF4BQ92750 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TAF4BQ92750 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TAF4BQ92750 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TAF4BQ92750 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TAF4BQ92750 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TAF4BQ92750 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TAF4BQ92750 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TAF4BQ92750 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TAF4BQ92750 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TAF4BQ92750 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TAF4BQ92750 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TAF4BQ92750 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TAF4BQ92750 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TAF4BQ92750 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TAF4BQ92750 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TAF4BQ92750 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TAF4BQ92750 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TAF4BQ92750 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TAF4BQ92750 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TAF4BQ92750 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TAF4BQ92750 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TAF4BQ92750 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TAF4BQ92750 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TAF4BQ92750 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TAF4BQ92750 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TAF4BQ92750 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TAF4BQ92750 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TAF4BQ92750 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TAF4BQ92750 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TAF4BQ92750 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TAF4BQ92750 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TAF4BQ92750 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TAF4BQ92750 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TAF4BQ92750 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TAF4BQ92750 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TAF4BQ92750 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TAF4BQ92750 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TAF4BQ92750 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TAF4BQ92750 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TAF4BQ92750 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TAF4BQ92750 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TAF4BQ92750 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TAF4BQ92750 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TAF4BQ92750 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TAF4BQ92750 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TAF4BQ92750 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TAF4BQ92750 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TAF4BQ92750 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TAF4BQ92750 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TAF4BQ92750 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TAF4BQ92750 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TAF4BQ92750 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TAF4BQ92750 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TAF4BQ92750 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TAF4BQ92750 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TAF4BQ92750 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TAF4BQ92750 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TAF4BQ92750 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TAF4BQ92750 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TAF4BQ92750 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TAF4BQ92750 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TAF4BQ92750 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TAF4BQ92750 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TAF4BQ92750 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TAF4BQ92750 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
TAF4BQ92750 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TAF4BQ92750 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TAF4BQ92750 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TAF4BQ92750 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TAF4BQ92750 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TAF4BQ92750 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TAF4BQ92750 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TAF4BQ92750 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TAF4BQ92750 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TAF4BQ92750 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TAF4BQ92750 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TAF4BQ92750 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TAF4BQ92750 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TAF4BQ92750 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TAF4BQ92750 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TAF4BQ92750 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TAF4BQ92750 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TAF4BQ92750 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TAF4BQ92750 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TAF4BQ92750 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TAF4BQ92750 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TAF4BQ92750 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TAF4BQ92750 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TAF4BQ92750 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TAF4BQ92750 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TAF4BQ92750 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TAF4BQ92750 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TAF4BQ92750 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms