Protein–RNA interactions for Protein: Q92729

PTPRU, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, humanhuman

Predictions only

Length 1,446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRUQ92729 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
PTPRUQ92729 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
PTPRUQ92729 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
PTPRUQ92729 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
PTPRUQ92729 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
PTPRUQ92729 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
PTPRUQ92729 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
PTPRUQ92729 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
PTPRUQ92729 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
PTPRUQ92729 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
PTPRUQ92729 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
PTPRUQ92729 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
PTPRUQ92729 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
PTPRUQ92729 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
PTPRUQ92729 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
PTPRUQ92729 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
PTPRUQ92729 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
PTPRUQ92729 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
PTPRUQ92729 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
PTPRUQ92729 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
PTPRUQ92729 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
PTPRUQ92729 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
PTPRUQ92729 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
PTPRUQ92729 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
PTPRUQ92729 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
PTPRUQ92729 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
PTPRUQ92729 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
PTPRUQ92729 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
PTPRUQ92729 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
PTPRUQ92729 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
PTPRUQ92729 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
PTPRUQ92729 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
PTPRUQ92729 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
PTPRUQ92729 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
PTPRUQ92729 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
PTPRUQ92729 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
PTPRUQ92729 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
PTPRUQ92729 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
PTPRUQ92729 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC32.15■■■□□ 2.74
PTPRUQ92729 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
PTPRUQ92729 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
PTPRUQ92729 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
PTPRUQ92729 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
PTPRUQ92729 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
PTPRUQ92729 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.73
PTPRUQ92729 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
PTPRUQ92729 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
PTPRUQ92729 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
PTPRUQ92729 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
PTPRUQ92729 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
PTPRUQ92729 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC32.13■■■□□ 2.73
PTPRUQ92729 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
PTPRUQ92729 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
PTPRUQ92729 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
PTPRUQ92729 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
PTPRUQ92729 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
PTPRUQ92729 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
PTPRUQ92729 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
PTPRUQ92729 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
PTPRUQ92729 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC32.12■■■□□ 2.73
PTPRUQ92729 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
PTPRUQ92729 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
PTPRUQ92729 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
PTPRUQ92729 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
PTPRUQ92729 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
PTPRUQ92729 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC32.11■■■□□ 2.73
PTPRUQ92729 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
PTPRUQ92729 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
PTPRUQ92729 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
PTPRUQ92729 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
PTPRUQ92729 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
PTPRUQ92729 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
PTPRUQ92729 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
PTPRUQ92729 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC32.09■■■□□ 2.73
PTPRUQ92729 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
PTPRUQ92729 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
PTPRUQ92729 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
PTPRUQ92729 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
PTPRUQ92729 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
PTPRUQ92729 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
PTPRUQ92729 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
PTPRUQ92729 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
PTPRUQ92729 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
PTPRUQ92729 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
PTPRUQ92729 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
PTPRUQ92729 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
PTPRUQ92729 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
PTPRUQ92729 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
PTPRUQ92729 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
PTPRUQ92729 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
PTPRUQ92729 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
PTPRUQ92729 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
PTPRUQ92729 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.73
PTPRUQ92729 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.73
PTPRUQ92729 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
PTPRUQ92729 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
PTPRUQ92729 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
PTPRUQ92729 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
PTPRUQ92729 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
PTPRUQ92729 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms