Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVB6

CHTF18, Chromosome transmission fidelity protein 18 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTF18Q8WVB6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHTF18Q8WVB6 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHTF18Q8WVB6 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CHTF18Q8WVB6 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHTF18Q8WVB6 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHTF18Q8WVB6 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHTF18Q8WVB6 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHTF18Q8WVB6 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CHTF18Q8WVB6 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHTF18Q8WVB6 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHTF18Q8WVB6 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHTF18Q8WVB6 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHTF18Q8WVB6 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CHTF18Q8WVB6 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHTF18Q8WVB6 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHTF18Q8WVB6 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHTF18Q8WVB6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHTF18Q8WVB6 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHTF18Q8WVB6 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHTF18Q8WVB6 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHTF18Q8WVB6 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHTF18Q8WVB6 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHTF18Q8WVB6 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHTF18Q8WVB6 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHTF18Q8WVB6 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHTF18Q8WVB6 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHTF18Q8WVB6 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHTF18Q8WVB6 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHTF18Q8WVB6 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHTF18Q8WVB6 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHTF18Q8WVB6 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHTF18Q8WVB6 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHTF18Q8WVB6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHTF18Q8WVB6 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHTF18Q8WVB6 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHTF18Q8WVB6 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHTF18Q8WVB6 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHTF18Q8WVB6 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHTF18Q8WVB6 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHTF18Q8WVB6 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHTF18Q8WVB6 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHTF18Q8WVB6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHTF18Q8WVB6 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHTF18Q8WVB6 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHTF18Q8WVB6 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHTF18Q8WVB6 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHTF18Q8WVB6 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CHTF18Q8WVB6 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHTF18Q8WVB6 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CHTF18Q8WVB6 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHTF18Q8WVB6 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHTF18Q8WVB6 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHTF18Q8WVB6 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHTF18Q8WVB6 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHTF18Q8WVB6 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CHTF18Q8WVB6 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CHTF18Q8WVB6 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CHTF18Q8WVB6 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHTF18Q8WVB6 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHTF18Q8WVB6 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHTF18Q8WVB6 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHTF18Q8WVB6 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHTF18Q8WVB6 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHTF18Q8WVB6 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHTF18Q8WVB6 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHTF18Q8WVB6 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHTF18Q8WVB6 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHTF18Q8WVB6 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHTF18Q8WVB6 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHTF18Q8WVB6 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHTF18Q8WVB6 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHTF18Q8WVB6 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHTF18Q8WVB6 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHTF18Q8WVB6 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CHTF18Q8WVB6 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHTF18Q8WVB6 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHTF18Q8WVB6 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHTF18Q8WVB6 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHTF18Q8WVB6 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CHTF18Q8WVB6 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHTF18Q8WVB6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHTF18Q8WVB6 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHTF18Q8WVB6 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHTF18Q8WVB6 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHTF18Q8WVB6 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHTF18Q8WVB6 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHTF18Q8WVB6 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHTF18Q8WVB6 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHTF18Q8WVB6 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHTF18Q8WVB6 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHTF18Q8WVB6 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHTF18Q8WVB6 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHTF18Q8WVB6 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CHTF18Q8WVB6 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHTF18Q8WVB6 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHTF18Q8WVB6 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHTF18Q8WVB6 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHTF18Q8WVB6 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHTF18Q8WVB6 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHTF18Q8WVB6 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms