Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEB9

RHBDD1, Rhomboid-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD1Q8TEB9 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RHBDD1Q8TEB9 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RHBDD1Q8TEB9 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RHBDD1Q8TEB9 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RHBDD1Q8TEB9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RHBDD1Q8TEB9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RHBDD1Q8TEB9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHBDD1Q8TEB9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHBDD1Q8TEB9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHBDD1Q8TEB9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHBDD1Q8TEB9 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHBDD1Q8TEB9 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHBDD1Q8TEB9 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHBDD1Q8TEB9 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHBDD1Q8TEB9 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHBDD1Q8TEB9 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHBDD1Q8TEB9 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RHBDD1Q8TEB9 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHBDD1Q8TEB9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHBDD1Q8TEB9 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHBDD1Q8TEB9 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RHBDD1Q8TEB9 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RHBDD1Q8TEB9 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RHBDD1Q8TEB9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RHBDD1Q8TEB9 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RHBDD1Q8TEB9 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RHBDD1Q8TEB9 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RHBDD1Q8TEB9 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RHBDD1Q8TEB9 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RHBDD1Q8TEB9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RHBDD1Q8TEB9 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RHBDD1Q8TEB9 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHBDD1Q8TEB9 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHBDD1Q8TEB9 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHBDD1Q8TEB9 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHBDD1Q8TEB9 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHBDD1Q8TEB9 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHBDD1Q8TEB9 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHBDD1Q8TEB9 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RHBDD1Q8TEB9 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHBDD1Q8TEB9 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHBDD1Q8TEB9 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHBDD1Q8TEB9 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHBDD1Q8TEB9 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RHBDD1Q8TEB9 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RHBDD1Q8TEB9 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RHBDD1Q8TEB9 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RHBDD1Q8TEB9 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RHBDD1Q8TEB9 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RHBDD1Q8TEB9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHBDD1Q8TEB9 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHBDD1Q8TEB9 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHBDD1Q8TEB9 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHBDD1Q8TEB9 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHBDD1Q8TEB9 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHBDD1Q8TEB9 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RHBDD1Q8TEB9 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHBDD1Q8TEB9 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHBDD1Q8TEB9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHBDD1Q8TEB9 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHBDD1Q8TEB9 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHBDD1Q8TEB9 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHBDD1Q8TEB9 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHBDD1Q8TEB9 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHBDD1Q8TEB9 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHBDD1Q8TEB9 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHBDD1Q8TEB9 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RHBDD1Q8TEB9 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHBDD1Q8TEB9 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHBDD1Q8TEB9 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHBDD1Q8TEB9 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHBDD1Q8TEB9 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RHBDD1Q8TEB9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RHBDD1Q8TEB9 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RHBDD1Q8TEB9 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RHBDD1Q8TEB9 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RHBDD1Q8TEB9 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RHBDD1Q8TEB9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RHBDD1Q8TEB9 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHBDD1Q8TEB9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHBDD1Q8TEB9 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHBDD1Q8TEB9 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHBDD1Q8TEB9 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHBDD1Q8TEB9 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHBDD1Q8TEB9 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RHBDD1Q8TEB9 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHBDD1Q8TEB9 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHBDD1Q8TEB9 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHBDD1Q8TEB9 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHBDD1Q8TEB9 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHBDD1Q8TEB9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHBDD1Q8TEB9 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHBDD1Q8TEB9 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHBDD1Q8TEB9 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHBDD1Q8TEB9 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHBDD1Q8TEB9 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHBDD1Q8TEB9 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHBDD1Q8TEB9 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RHBDD1Q8TEB9 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RHBDD1Q8TEB9 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms