Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDR0

TRAF3IP1, TRAF3-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3IP1Q8TDR0 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAF3IP1Q8TDR0 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAF3IP1Q8TDR0 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAF3IP1Q8TDR0 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAF3IP1Q8TDR0 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAF3IP1Q8TDR0 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAF3IP1Q8TDR0 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAF3IP1Q8TDR0 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAF3IP1Q8TDR0 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAF3IP1Q8TDR0 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAF3IP1Q8TDR0 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAF3IP1Q8TDR0 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAF3IP1Q8TDR0 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAF3IP1Q8TDR0 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAF3IP1Q8TDR0 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAF3IP1Q8TDR0 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAF3IP1Q8TDR0 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAF3IP1Q8TDR0 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAF3IP1Q8TDR0 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAF3IP1Q8TDR0 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAF3IP1Q8TDR0 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAF3IP1Q8TDR0 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAF3IP1Q8TDR0 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAF3IP1Q8TDR0 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAF3IP1Q8TDR0 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAF3IP1Q8TDR0 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAF3IP1Q8TDR0 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAF3IP1Q8TDR0 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAF3IP1Q8TDR0 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAF3IP1Q8TDR0 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAF3IP1Q8TDR0 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAF3IP1Q8TDR0 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAF3IP1Q8TDR0 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAF3IP1Q8TDR0 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAF3IP1Q8TDR0 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAF3IP1Q8TDR0 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAF3IP1Q8TDR0 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAF3IP1Q8TDR0 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAF3IP1Q8TDR0 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAF3IP1Q8TDR0 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAF3IP1Q8TDR0 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAF3IP1Q8TDR0 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAF3IP1Q8TDR0 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAF3IP1Q8TDR0 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAF3IP1Q8TDR0 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAF3IP1Q8TDR0 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAF3IP1Q8TDR0 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAF3IP1Q8TDR0 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAF3IP1Q8TDR0 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAF3IP1Q8TDR0 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAF3IP1Q8TDR0 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAF3IP1Q8TDR0 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAF3IP1Q8TDR0 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAF3IP1Q8TDR0 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAF3IP1Q8TDR0 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAF3IP1Q8TDR0 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAF3IP1Q8TDR0 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAF3IP1Q8TDR0 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAF3IP1Q8TDR0 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAF3IP1Q8TDR0 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAF3IP1Q8TDR0 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAF3IP1Q8TDR0 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAF3IP1Q8TDR0 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAF3IP1Q8TDR0 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAF3IP1Q8TDR0 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAF3IP1Q8TDR0 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAF3IP1Q8TDR0 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAF3IP1Q8TDR0 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAF3IP1Q8TDR0 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAF3IP1Q8TDR0 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAF3IP1Q8TDR0 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAF3IP1Q8TDR0 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAF3IP1Q8TDR0 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAF3IP1Q8TDR0 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAF3IP1Q8TDR0 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAF3IP1Q8TDR0 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAF3IP1Q8TDR0 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAF3IP1Q8TDR0 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAF3IP1Q8TDR0 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAF3IP1Q8TDR0 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAF3IP1Q8TDR0 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAF3IP1Q8TDR0 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAF3IP1Q8TDR0 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAF3IP1Q8TDR0 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAF3IP1Q8TDR0 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAF3IP1Q8TDR0 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAF3IP1Q8TDR0 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAF3IP1Q8TDR0 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAF3IP1Q8TDR0 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAF3IP1Q8TDR0 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAF3IP1Q8TDR0 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAF3IP1Q8TDR0 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAF3IP1Q8TDR0 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAF3IP1Q8TDR0 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAF3IP1Q8TDR0 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAF3IP1Q8TDR0 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAF3IP1Q8TDR0 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAF3IP1Q8TDR0 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAF3IP1Q8TDR0 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAF3IP1Q8TDR0 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69 ms