Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBB5

KLHDC4, Kelch domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC4Q8TBB5 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
KLHDC4Q8TBB5 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
KLHDC4Q8TBB5 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
KLHDC4Q8TBB5 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
KLHDC4Q8TBB5 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
KLHDC4Q8TBB5 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
KLHDC4Q8TBB5 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
KLHDC4Q8TBB5 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
KLHDC4Q8TBB5 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
KLHDC4Q8TBB5 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
KLHDC4Q8TBB5 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
KLHDC4Q8TBB5 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
KLHDC4Q8TBB5 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
KLHDC4Q8TBB5 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
KLHDC4Q8TBB5 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
KLHDC4Q8TBB5 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
KLHDC4Q8TBB5 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
KLHDC4Q8TBB5 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
KLHDC4Q8TBB5 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
KLHDC4Q8TBB5 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
KLHDC4Q8TBB5 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
KLHDC4Q8TBB5 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
KLHDC4Q8TBB5 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
KLHDC4Q8TBB5 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
KLHDC4Q8TBB5 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
KLHDC4Q8TBB5 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
KLHDC4Q8TBB5 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
KLHDC4Q8TBB5 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
KLHDC4Q8TBB5 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
KLHDC4Q8TBB5 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
KLHDC4Q8TBB5 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
KLHDC4Q8TBB5 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
KLHDC4Q8TBB5 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
KLHDC4Q8TBB5 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
KLHDC4Q8TBB5 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
KLHDC4Q8TBB5 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
KLHDC4Q8TBB5 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
KLHDC4Q8TBB5 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
KLHDC4Q8TBB5 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
KLHDC4Q8TBB5 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
KLHDC4Q8TBB5 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
KLHDC4Q8TBB5 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
KLHDC4Q8TBB5 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
KLHDC4Q8TBB5 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
KLHDC4Q8TBB5 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
KLHDC4Q8TBB5 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
KLHDC4Q8TBB5 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
KLHDC4Q8TBB5 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
KLHDC4Q8TBB5 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
KLHDC4Q8TBB5 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KLHDC4Q8TBB5 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KLHDC4Q8TBB5 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KLHDC4Q8TBB5 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KLHDC4Q8TBB5 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
KLHDC4Q8TBB5 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KLHDC4Q8TBB5 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
KLHDC4Q8TBB5 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KLHDC4Q8TBB5 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KLHDC4Q8TBB5 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KLHDC4Q8TBB5 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
KLHDC4Q8TBB5 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KLHDC4Q8TBB5 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
KLHDC4Q8TBB5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
KLHDC4Q8TBB5 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
KLHDC4Q8TBB5 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
KLHDC4Q8TBB5 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
KLHDC4Q8TBB5 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
KLHDC4Q8TBB5 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
KLHDC4Q8TBB5 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
KLHDC4Q8TBB5 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
KLHDC4Q8TBB5 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
KLHDC4Q8TBB5 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
KLHDC4Q8TBB5 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
KLHDC4Q8TBB5 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KLHDC4Q8TBB5 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KLHDC4Q8TBB5 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
KLHDC4Q8TBB5 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KLHDC4Q8TBB5 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
KLHDC4Q8TBB5 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
KLHDC4Q8TBB5 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KLHDC4Q8TBB5 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
KLHDC4Q8TBB5 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
KLHDC4Q8TBB5 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
KLHDC4Q8TBB5 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
KLHDC4Q8TBB5 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
KLHDC4Q8TBB5 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
KLHDC4Q8TBB5 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
KLHDC4Q8TBB5 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
KLHDC4Q8TBB5 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
KLHDC4Q8TBB5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
KLHDC4Q8TBB5 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
KLHDC4Q8TBB5 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
KLHDC4Q8TBB5 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
KLHDC4Q8TBB5 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
KLHDC4Q8TBB5 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
KLHDC4Q8TBB5 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
KLHDC4Q8TBB5 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
KLHDC4Q8TBB5 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
KLHDC4Q8TBB5 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
KLHDC4Q8TBB5 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms