Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAP4

LMO3, LIM domain only protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3Q8TAP4 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
LMO3Q8TAP4 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMO3Q8TAP4 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMO3Q8TAP4 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMO3Q8TAP4 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMO3Q8TAP4 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMO3Q8TAP4 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMO3Q8TAP4 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMO3Q8TAP4 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMO3Q8TAP4 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMO3Q8TAP4 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMO3Q8TAP4 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LMO3Q8TAP4 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LMO3Q8TAP4 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LMO3Q8TAP4 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LMO3Q8TAP4 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LMO3Q8TAP4 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LMO3Q8TAP4 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
LMO3Q8TAP4 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
LMO3Q8TAP4 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LMO3Q8TAP4 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LMO3Q8TAP4 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LMO3Q8TAP4 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
LMO3Q8TAP4 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LMO3Q8TAP4 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LMO3Q8TAP4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LMO3Q8TAP4 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LMO3Q8TAP4 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LMO3Q8TAP4 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LMO3Q8TAP4 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LMO3Q8TAP4 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LMO3Q8TAP4 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LMO3Q8TAP4 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LMO3Q8TAP4 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LMO3Q8TAP4 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LMO3Q8TAP4 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LMO3Q8TAP4 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LMO3Q8TAP4 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LMO3Q8TAP4 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMO3Q8TAP4 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMO3Q8TAP4 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMO3Q8TAP4 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMO3Q8TAP4 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMO3Q8TAP4 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMO3Q8TAP4 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMO3Q8TAP4 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMO3Q8TAP4 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMO3Q8TAP4 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
LMO3Q8TAP4 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMO3Q8TAP4 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMO3Q8TAP4 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMO3Q8TAP4 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMO3Q8TAP4 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMO3Q8TAP4 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMO3Q8TAP4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMO3Q8TAP4 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMO3Q8TAP4 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMO3Q8TAP4 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMO3Q8TAP4 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMO3Q8TAP4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMO3Q8TAP4 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMO3Q8TAP4 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMO3Q8TAP4 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
LMO3Q8TAP4 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMO3Q8TAP4 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMO3Q8TAP4 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMO3Q8TAP4 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMO3Q8TAP4 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMO3Q8TAP4 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMO3Q8TAP4 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMO3Q8TAP4 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMO3Q8TAP4 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMO3Q8TAP4 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMO3Q8TAP4 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMO3Q8TAP4 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMO3Q8TAP4 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMO3Q8TAP4 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMO3Q8TAP4 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMO3Q8TAP4 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
LMO3Q8TAP4 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMO3Q8TAP4 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMO3Q8TAP4 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMO3Q8TAP4 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMO3Q8TAP4 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMO3Q8TAP4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMO3Q8TAP4 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMO3Q8TAP4 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMO3Q8TAP4 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMO3Q8TAP4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LMO3Q8TAP4 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LMO3Q8TAP4 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LMO3Q8TAP4 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
LMO3Q8TAP4 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LMO3Q8TAP4 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LMO3Q8TAP4 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LMO3Q8TAP4 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LMO3Q8TAP4 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LMO3Q8TAP4 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LMO3Q8TAP4 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LMO3Q8TAP4 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms