Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG08

HELB, DNA helicase B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELBQ8NG08 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
HELBQ8NG08 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
HELBQ8NG08 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HELBQ8NG08 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
HELBQ8NG08 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
HELBQ8NG08 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HELBQ8NG08 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HELBQ8NG08 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HELBQ8NG08 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HELBQ8NG08 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HELBQ8NG08 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HELBQ8NG08 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HELBQ8NG08 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HELBQ8NG08 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HELBQ8NG08 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HELBQ8NG08 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HELBQ8NG08 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HELBQ8NG08 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HELBQ8NG08 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
HELBQ8NG08 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HELBQ8NG08 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HELBQ8NG08 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
HELBQ8NG08 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
HELBQ8NG08 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
HELBQ8NG08 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HELBQ8NG08 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HELBQ8NG08 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HELBQ8NG08 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
HELBQ8NG08 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
HELBQ8NG08 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
HELBQ8NG08 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
HELBQ8NG08 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
HELBQ8NG08 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
HELBQ8NG08 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HELBQ8NG08 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HELBQ8NG08 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
HELBQ8NG08 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
HELBQ8NG08 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
HELBQ8NG08 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
HELBQ8NG08 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
HELBQ8NG08 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
HELBQ8NG08 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
HELBQ8NG08 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
HELBQ8NG08 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HELBQ8NG08 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HELBQ8NG08 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HELBQ8NG08 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HELBQ8NG08 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HELBQ8NG08 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HELBQ8NG08 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HELBQ8NG08 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
HELBQ8NG08 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
HELBQ8NG08 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HELBQ8NG08 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HELBQ8NG08 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HELBQ8NG08 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HELBQ8NG08 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HELBQ8NG08 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HELBQ8NG08 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
HELBQ8NG08 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
HELBQ8NG08 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
HELBQ8NG08 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HELBQ8NG08 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HELBQ8NG08 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HELBQ8NG08 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HELBQ8NG08 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HELBQ8NG08 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HELBQ8NG08 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HELBQ8NG08 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HELBQ8NG08 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HELBQ8NG08 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HELBQ8NG08 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
HELBQ8NG08 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
HELBQ8NG08 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
HELBQ8NG08 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
HELBQ8NG08 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
HELBQ8NG08 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
HELBQ8NG08 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
HELBQ8NG08 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
HELBQ8NG08 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
HELBQ8NG08 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
HELBQ8NG08 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
HELBQ8NG08 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HELBQ8NG08 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
HELBQ8NG08 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
HELBQ8NG08 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
HELBQ8NG08 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
HELBQ8NG08 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
HELBQ8NG08 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HELBQ8NG08 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
HELBQ8NG08 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
HELBQ8NG08 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HELBQ8NG08 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
HELBQ8NG08 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HELBQ8NG08 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HELBQ8NG08 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HELBQ8NG08 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HELBQ8NG08 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
HELBQ8NG08 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HELBQ8NG08 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms