Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG06

TRIM58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, humanhuman

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM58Q8NG06 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM58Q8NG06 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM58Q8NG06 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM58Q8NG06 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM58Q8NG06 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM58Q8NG06 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM58Q8NG06 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM58Q8NG06 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM58Q8NG06 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM58Q8NG06 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM58Q8NG06 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM58Q8NG06 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM58Q8NG06 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM58Q8NG06 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM58Q8NG06 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM58Q8NG06 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM58Q8NG06 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM58Q8NG06 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM58Q8NG06 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM58Q8NG06 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM58Q8NG06 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM58Q8NG06 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM58Q8NG06 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM58Q8NG06 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM58Q8NG06 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM58Q8NG06 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM58Q8NG06 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM58Q8NG06 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRIM58Q8NG06 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRIM58Q8NG06 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRIM58Q8NG06 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRIM58Q8NG06 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM58Q8NG06 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM58Q8NG06 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM58Q8NG06 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM58Q8NG06 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM58Q8NG06 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM58Q8NG06 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM58Q8NG06 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM58Q8NG06 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM58Q8NG06 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM58Q8NG06 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM58Q8NG06 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM58Q8NG06 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM58Q8NG06 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM58Q8NG06 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM58Q8NG06 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM58Q8NG06 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM58Q8NG06 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM58Q8NG06 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM58Q8NG06 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM58Q8NG06 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM58Q8NG06 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM58Q8NG06 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM58Q8NG06 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM58Q8NG06 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM58Q8NG06 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM58Q8NG06 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM58Q8NG06 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM58Q8NG06 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM58Q8NG06 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM58Q8NG06 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM58Q8NG06 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM58Q8NG06 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM58Q8NG06 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM58Q8NG06 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM58Q8NG06 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM58Q8NG06 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM58Q8NG06 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM58Q8NG06 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM58Q8NG06 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM58Q8NG06 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM58Q8NG06 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM58Q8NG06 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM58Q8NG06 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM58Q8NG06 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM58Q8NG06 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM58Q8NG06 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM58Q8NG06 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM58Q8NG06 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM58Q8NG06 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM58Q8NG06 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM58Q8NG06 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM58Q8NG06 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM58Q8NG06 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM58Q8NG06 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM58Q8NG06 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM58Q8NG06 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM58Q8NG06 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM58Q8NG06 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM58Q8NG06 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM58Q8NG06 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM58Q8NG06 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM58Q8NG06 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM58Q8NG06 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM58Q8NG06 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM58Q8NG06 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM58Q8NG06 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM58Q8NG06 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM58Q8NG06 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms