Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA66

CNBD1, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD1Q8NA66 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CNBD1Q8NA66 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CNBD1Q8NA66 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CNBD1Q8NA66 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CNBD1Q8NA66 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CNBD1Q8NA66 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
CNBD1Q8NA66 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CNBD1Q8NA66 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CNBD1Q8NA66 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CNBD1Q8NA66 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CNBD1Q8NA66 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CNBD1Q8NA66 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CNBD1Q8NA66 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CNBD1Q8NA66 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CNBD1Q8NA66 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CNBD1Q8NA66 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CNBD1Q8NA66 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CNBD1Q8NA66 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CNBD1Q8NA66 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CNBD1Q8NA66 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CNBD1Q8NA66 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CNBD1Q8NA66 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CNBD1Q8NA66 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CNBD1Q8NA66 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CNBD1Q8NA66 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CNBD1Q8NA66 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CNBD1Q8NA66 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CNBD1Q8NA66 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CNBD1Q8NA66 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CNBD1Q8NA66 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CNBD1Q8NA66 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
CNBD1Q8NA66 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CNBD1Q8NA66 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CNBD1Q8NA66 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CNBD1Q8NA66 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CNBD1Q8NA66 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CNBD1Q8NA66 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CNBD1Q8NA66 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CNBD1Q8NA66 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CNBD1Q8NA66 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CNBD1Q8NA66 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CNBD1Q8NA66 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CNBD1Q8NA66 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CNBD1Q8NA66 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CNBD1Q8NA66 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CNBD1Q8NA66 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CNBD1Q8NA66 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CNBD1Q8NA66 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CNBD1Q8NA66 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CNBD1Q8NA66 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CNBD1Q8NA66 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CNBD1Q8NA66 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CNBD1Q8NA66 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CNBD1Q8NA66 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CNBD1Q8NA66 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
CNBD1Q8NA66 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CNBD1Q8NA66 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
CNBD1Q8NA66 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
CNBD1Q8NA66 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
CNBD1Q8NA66 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
CNBD1Q8NA66 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
CNBD1Q8NA66 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
CNBD1Q8NA66 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CNBD1Q8NA66 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CNBD1Q8NA66 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CNBD1Q8NA66 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CNBD1Q8NA66 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CNBD1Q8NA66 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CNBD1Q8NA66 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CNBD1Q8NA66 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CNBD1Q8NA66 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CNBD1Q8NA66 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CNBD1Q8NA66 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CNBD1Q8NA66 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CNBD1Q8NA66 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CNBD1Q8NA66 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CNBD1Q8NA66 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CNBD1Q8NA66 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CNBD1Q8NA66 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CNBD1Q8NA66 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CNBD1Q8NA66 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CNBD1Q8NA66 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CNBD1Q8NA66 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CNBD1Q8NA66 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CNBD1Q8NA66 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CNBD1Q8NA66 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CNBD1Q8NA66 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CNBD1Q8NA66 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CNBD1Q8NA66 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CNBD1Q8NA66 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CNBD1Q8NA66 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CNBD1Q8NA66 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CNBD1Q8NA66 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CNBD1Q8NA66 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
CNBD1Q8NA66 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
CNBD1Q8NA66 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CNBD1Q8NA66 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CNBD1Q8NA66 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CNBD1Q8NA66 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CNBD1Q8NA66 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms