Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3J5

PPM1K, Protein phosphatase 1K, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPM1KQ8N3J5 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PPM1KQ8N3J5 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PPM1KQ8N3J5 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PPM1KQ8N3J5 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PPM1KQ8N3J5 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PPM1KQ8N3J5 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PPM1KQ8N3J5 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PPM1KQ8N3J5 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PPM1KQ8N3J5 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PPM1KQ8N3J5 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PPM1KQ8N3J5 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PPM1KQ8N3J5 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PPM1KQ8N3J5 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PPM1KQ8N3J5 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PPM1KQ8N3J5 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PPM1KQ8N3J5 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PPM1KQ8N3J5 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PPM1KQ8N3J5 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PPM1KQ8N3J5 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PPM1KQ8N3J5 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PPM1KQ8N3J5 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PPM1KQ8N3J5 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PPM1KQ8N3J5 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PPM1KQ8N3J5 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PPM1KQ8N3J5 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PPM1KQ8N3J5 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PPM1KQ8N3J5 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PPM1KQ8N3J5 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PPM1KQ8N3J5 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PPM1KQ8N3J5 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PPM1KQ8N3J5 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PPM1KQ8N3J5 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PPM1KQ8N3J5 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PPM1KQ8N3J5 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PPM1KQ8N3J5 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PPM1KQ8N3J5 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PPM1KQ8N3J5 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PPM1KQ8N3J5 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PPM1KQ8N3J5 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PPM1KQ8N3J5 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PPM1KQ8N3J5 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PPM1KQ8N3J5 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PPM1KQ8N3J5 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PPM1KQ8N3J5 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PPM1KQ8N3J5 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPM1KQ8N3J5 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPM1KQ8N3J5 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPM1KQ8N3J5 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPM1KQ8N3J5 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPM1KQ8N3J5 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPM1KQ8N3J5 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PPM1KQ8N3J5 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PPM1KQ8N3J5 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PPM1KQ8N3J5 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PPM1KQ8N3J5 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PPM1KQ8N3J5 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PPM1KQ8N3J5 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PPM1KQ8N3J5 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PPM1KQ8N3J5 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PPM1KQ8N3J5 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PPM1KQ8N3J5 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PPM1KQ8N3J5 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PPM1KQ8N3J5 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPM1KQ8N3J5 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPM1KQ8N3J5 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PPM1KQ8N3J5 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PPM1KQ8N3J5 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PPM1KQ8N3J5 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPM1KQ8N3J5 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPM1KQ8N3J5 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPM1KQ8N3J5 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPM1KQ8N3J5 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPM1KQ8N3J5 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPM1KQ8N3J5 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PPM1KQ8N3J5 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PPM1KQ8N3J5 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPM1KQ8N3J5 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPM1KQ8N3J5 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPM1KQ8N3J5 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPM1KQ8N3J5 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPM1KQ8N3J5 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPM1KQ8N3J5 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPM1KQ8N3J5 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPM1KQ8N3J5 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPM1KQ8N3J5 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPM1KQ8N3J5 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPM1KQ8N3J5 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPM1KQ8N3J5 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPM1KQ8N3J5 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPM1KQ8N3J5 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPM1KQ8N3J5 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPM1KQ8N3J5 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPM1KQ8N3J5 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPM1KQ8N3J5 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPM1KQ8N3J5 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPM1KQ8N3J5 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PPM1KQ8N3J5 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PPM1KQ8N3J5 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPM1KQ8N3J5 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPM1KQ8N3J5 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms