Protein–RNA interactions for Protein: Q8N271

PROM2, Prominin-2, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROM2Q8N271 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
PROM2Q8N271 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PROM2Q8N271 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PROM2Q8N271 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PROM2Q8N271 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PROM2Q8N271 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PROM2Q8N271 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PROM2Q8N271 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PROM2Q8N271 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PROM2Q8N271 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PROM2Q8N271 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PROM2Q8N271 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PROM2Q8N271 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PROM2Q8N271 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PROM2Q8N271 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PROM2Q8N271 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PROM2Q8N271 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PROM2Q8N271 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PROM2Q8N271 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
PROM2Q8N271 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PROM2Q8N271 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PROM2Q8N271 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PROM2Q8N271 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PROM2Q8N271 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
PROM2Q8N271 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PROM2Q8N271 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PROM2Q8N271 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PROM2Q8N271 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PROM2Q8N271 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PROM2Q8N271 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PROM2Q8N271 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PROM2Q8N271 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PROM2Q8N271 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PROM2Q8N271 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PROM2Q8N271 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PROM2Q8N271 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PROM2Q8N271 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PROM2Q8N271 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PROM2Q8N271 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PROM2Q8N271 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PROM2Q8N271 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PROM2Q8N271 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
PROM2Q8N271 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PROM2Q8N271 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
PROM2Q8N271 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PROM2Q8N271 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PROM2Q8N271 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PROM2Q8N271 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PROM2Q8N271 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PROM2Q8N271 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PROM2Q8N271 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PROM2Q8N271 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PROM2Q8N271 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PROM2Q8N271 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PROM2Q8N271 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PROM2Q8N271 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PROM2Q8N271 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PROM2Q8N271 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PROM2Q8N271 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
PROM2Q8N271 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PROM2Q8N271 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PROM2Q8N271 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PROM2Q8N271 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PROM2Q8N271 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PROM2Q8N271 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PROM2Q8N271 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PROM2Q8N271 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PROM2Q8N271 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PROM2Q8N271 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PROM2Q8N271 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PROM2Q8N271 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PROM2Q8N271 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PROM2Q8N271 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PROM2Q8N271 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PROM2Q8N271 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PROM2Q8N271 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PROM2Q8N271 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PROM2Q8N271 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PROM2Q8N271 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PROM2Q8N271 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PROM2Q8N271 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PROM2Q8N271 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PROM2Q8N271 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PROM2Q8N271 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PROM2Q8N271 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PROM2Q8N271 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PROM2Q8N271 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PROM2Q8N271 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PROM2Q8N271 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PROM2Q8N271 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PROM2Q8N271 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PROM2Q8N271 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PROM2Q8N271 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PROM2Q8N271 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PROM2Q8N271 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PROM2Q8N271 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PROM2Q8N271 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PROM2Q8N271 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PROM2Q8N271 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PROM2Q8N271 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms