Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZ21

PHACTR4, Phosphatase and actin regulator 4, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR4Q8IZ21 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHACTR4Q8IZ21 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHACTR4Q8IZ21 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHACTR4Q8IZ21 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PHACTR4Q8IZ21 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHACTR4Q8IZ21 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHACTR4Q8IZ21 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PHACTR4Q8IZ21 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PHACTR4Q8IZ21 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PHACTR4Q8IZ21 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PHACTR4Q8IZ21 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PHACTR4Q8IZ21 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PHACTR4Q8IZ21 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PHACTR4Q8IZ21 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PHACTR4Q8IZ21 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PHACTR4Q8IZ21 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PHACTR4Q8IZ21 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PHACTR4Q8IZ21 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PHACTR4Q8IZ21 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PHACTR4Q8IZ21 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PHACTR4Q8IZ21 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PHACTR4Q8IZ21 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PHACTR4Q8IZ21 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PHACTR4Q8IZ21 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PHACTR4Q8IZ21 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PHACTR4Q8IZ21 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PHACTR4Q8IZ21 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PHACTR4Q8IZ21 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PHACTR4Q8IZ21 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PHACTR4Q8IZ21 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PHACTR4Q8IZ21 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PHACTR4Q8IZ21 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PHACTR4Q8IZ21 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PHACTR4Q8IZ21 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PHACTR4Q8IZ21 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PHACTR4Q8IZ21 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PHACTR4Q8IZ21 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PHACTR4Q8IZ21 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PHACTR4Q8IZ21 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PHACTR4Q8IZ21 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PHACTR4Q8IZ21 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PHACTR4Q8IZ21 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PHACTR4Q8IZ21 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PHACTR4Q8IZ21 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PHACTR4Q8IZ21 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PHACTR4Q8IZ21 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PHACTR4Q8IZ21 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PHACTR4Q8IZ21 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PHACTR4Q8IZ21 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PHACTR4Q8IZ21 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PHACTR4Q8IZ21 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PHACTR4Q8IZ21 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PHACTR4Q8IZ21 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PHACTR4Q8IZ21 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PHACTR4Q8IZ21 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHACTR4Q8IZ21 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHACTR4Q8IZ21 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHACTR4Q8IZ21 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHACTR4Q8IZ21 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHACTR4Q8IZ21 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHACTR4Q8IZ21 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHACTR4Q8IZ21 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHACTR4Q8IZ21 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHACTR4Q8IZ21 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHACTR4Q8IZ21 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHACTR4Q8IZ21 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHACTR4Q8IZ21 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHACTR4Q8IZ21 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHACTR4Q8IZ21 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHACTR4Q8IZ21 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHACTR4Q8IZ21 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHACTR4Q8IZ21 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHACTR4Q8IZ21 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHACTR4Q8IZ21 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PHACTR4Q8IZ21 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHACTR4Q8IZ21 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHACTR4Q8IZ21 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHACTR4Q8IZ21 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHACTR4Q8IZ21 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHACTR4Q8IZ21 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHACTR4Q8IZ21 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHACTR4Q8IZ21 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHACTR4Q8IZ21 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PHACTR4Q8IZ21 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHACTR4Q8IZ21 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHACTR4Q8IZ21 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PHACTR4Q8IZ21 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHACTR4Q8IZ21 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHACTR4Q8IZ21 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHACTR4Q8IZ21 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHACTR4Q8IZ21 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHACTR4Q8IZ21 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHACTR4Q8IZ21 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHACTR4Q8IZ21 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHACTR4Q8IZ21 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHACTR4Q8IZ21 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHACTR4Q8IZ21 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHACTR4Q8IZ21 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHACTR4Q8IZ21 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHACTR4Q8IZ21 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms