Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVD9

NUDCD3, NudC domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCD3Q8IVD9 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUDCD3Q8IVD9 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUDCD3Q8IVD9 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUDCD3Q8IVD9 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUDCD3Q8IVD9 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUDCD3Q8IVD9 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUDCD3Q8IVD9 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUDCD3Q8IVD9 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUDCD3Q8IVD9 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUDCD3Q8IVD9 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUDCD3Q8IVD9 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUDCD3Q8IVD9 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUDCD3Q8IVD9 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUDCD3Q8IVD9 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUDCD3Q8IVD9 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUDCD3Q8IVD9 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUDCD3Q8IVD9 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUDCD3Q8IVD9 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUDCD3Q8IVD9 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NUDCD3Q8IVD9 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NUDCD3Q8IVD9 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUDCD3Q8IVD9 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUDCD3Q8IVD9 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUDCD3Q8IVD9 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUDCD3Q8IVD9 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NUDCD3Q8IVD9 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
NUDCD3Q8IVD9 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUDCD3Q8IVD9 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUDCD3Q8IVD9 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUDCD3Q8IVD9 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NUDCD3Q8IVD9 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUDCD3Q8IVD9 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUDCD3Q8IVD9 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUDCD3Q8IVD9 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUDCD3Q8IVD9 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUDCD3Q8IVD9 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUDCD3Q8IVD9 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUDCD3Q8IVD9 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUDCD3Q8IVD9 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUDCD3Q8IVD9 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUDCD3Q8IVD9 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUDCD3Q8IVD9 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUDCD3Q8IVD9 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUDCD3Q8IVD9 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUDCD3Q8IVD9 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUDCD3Q8IVD9 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUDCD3Q8IVD9 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUDCD3Q8IVD9 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUDCD3Q8IVD9 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUDCD3Q8IVD9 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUDCD3Q8IVD9 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUDCD3Q8IVD9 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUDCD3Q8IVD9 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUDCD3Q8IVD9 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUDCD3Q8IVD9 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUDCD3Q8IVD9 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUDCD3Q8IVD9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUDCD3Q8IVD9 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUDCD3Q8IVD9 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUDCD3Q8IVD9 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUDCD3Q8IVD9 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUDCD3Q8IVD9 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUDCD3Q8IVD9 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUDCD3Q8IVD9 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUDCD3Q8IVD9 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUDCD3Q8IVD9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUDCD3Q8IVD9 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUDCD3Q8IVD9 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUDCD3Q8IVD9 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUDCD3Q8IVD9 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUDCD3Q8IVD9 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NUDCD3Q8IVD9 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUDCD3Q8IVD9 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUDCD3Q8IVD9 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUDCD3Q8IVD9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUDCD3Q8IVD9 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUDCD3Q8IVD9 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUDCD3Q8IVD9 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUDCD3Q8IVD9 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUDCD3Q8IVD9 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUDCD3Q8IVD9 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUDCD3Q8IVD9 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NUDCD3Q8IVD9 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUDCD3Q8IVD9 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUDCD3Q8IVD9 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUDCD3Q8IVD9 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUDCD3Q8IVD9 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUDCD3Q8IVD9 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUDCD3Q8IVD9 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUDCD3Q8IVD9 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUDCD3Q8IVD9 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUDCD3Q8IVD9 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUDCD3Q8IVD9 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NUDCD3Q8IVD9 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUDCD3Q8IVD9 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUDCD3Q8IVD9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUDCD3Q8IVD9 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUDCD3Q8IVD9 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUDCD3Q8IVD9 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUDCD3Q8IVD9 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms