Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUX4

APOBEC3F, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3F, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3FQ8IUX4 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
APOBEC3FQ8IUX4 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
APOBEC3FQ8IUX4 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
APOBEC3FQ8IUX4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
APOBEC3FQ8IUX4 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
APOBEC3FQ8IUX4 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
APOBEC3FQ8IUX4 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
APOBEC3FQ8IUX4 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
APOBEC3FQ8IUX4 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
APOBEC3FQ8IUX4 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
APOBEC3FQ8IUX4 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
APOBEC3FQ8IUX4 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
APOBEC3FQ8IUX4 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
APOBEC3FQ8IUX4 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
APOBEC3FQ8IUX4 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
APOBEC3FQ8IUX4 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
APOBEC3FQ8IUX4 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
APOBEC3FQ8IUX4 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
APOBEC3FQ8IUX4 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
APOBEC3FQ8IUX4 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
APOBEC3FQ8IUX4 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
APOBEC3FQ8IUX4 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
APOBEC3FQ8IUX4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
APOBEC3FQ8IUX4 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
APOBEC3FQ8IUX4 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
APOBEC3FQ8IUX4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
APOBEC3FQ8IUX4 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
APOBEC3FQ8IUX4 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
APOBEC3FQ8IUX4 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
APOBEC3FQ8IUX4 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
APOBEC3FQ8IUX4 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
APOBEC3FQ8IUX4 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
APOBEC3FQ8IUX4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
APOBEC3FQ8IUX4 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
APOBEC3FQ8IUX4 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
APOBEC3FQ8IUX4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
APOBEC3FQ8IUX4 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
APOBEC3FQ8IUX4 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
APOBEC3FQ8IUX4 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
APOBEC3FQ8IUX4 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
APOBEC3FQ8IUX4 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
APOBEC3FQ8IUX4 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
APOBEC3FQ8IUX4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
APOBEC3FQ8IUX4 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
APOBEC3FQ8IUX4 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
APOBEC3FQ8IUX4 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
APOBEC3FQ8IUX4 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
APOBEC3FQ8IUX4 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
APOBEC3FQ8IUX4 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
APOBEC3FQ8IUX4 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
APOBEC3FQ8IUX4 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
APOBEC3FQ8IUX4 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
APOBEC3FQ8IUX4 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
APOBEC3FQ8IUX4 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
APOBEC3FQ8IUX4 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
APOBEC3FQ8IUX4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
APOBEC3FQ8IUX4 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
APOBEC3FQ8IUX4 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
APOBEC3FQ8IUX4 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
APOBEC3FQ8IUX4 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
APOBEC3FQ8IUX4 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
APOBEC3FQ8IUX4 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
APOBEC3FQ8IUX4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
APOBEC3FQ8IUX4 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
APOBEC3FQ8IUX4 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
APOBEC3FQ8IUX4 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
APOBEC3FQ8IUX4 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
APOBEC3FQ8IUX4 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
APOBEC3FQ8IUX4 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
APOBEC3FQ8IUX4 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
APOBEC3FQ8IUX4 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
APOBEC3FQ8IUX4 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
APOBEC3FQ8IUX4 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
APOBEC3FQ8IUX4 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
APOBEC3FQ8IUX4 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
APOBEC3FQ8IUX4 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
APOBEC3FQ8IUX4 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
APOBEC3FQ8IUX4 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
APOBEC3FQ8IUX4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
APOBEC3FQ8IUX4 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
APOBEC3FQ8IUX4 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
APOBEC3FQ8IUX4 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
APOBEC3FQ8IUX4 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
APOBEC3FQ8IUX4 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
APOBEC3FQ8IUX4 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
APOBEC3FQ8IUX4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
APOBEC3FQ8IUX4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
APOBEC3FQ8IUX4 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
APOBEC3FQ8IUX4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
APOBEC3FQ8IUX4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
APOBEC3FQ8IUX4 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
APOBEC3FQ8IUX4 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
APOBEC3FQ8IUX4 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
APOBEC3FQ8IUX4 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
APOBEC3FQ8IUX4 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
APOBEC3FQ8IUX4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
APOBEC3FQ8IUX4 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
APOBEC3FQ8IUX4 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
APOBEC3FQ8IUX4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
APOBEC3FQ8IUX4 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms