Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNMB4Q86W47 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNMB4Q86W47 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNMB4Q86W47 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNMB4Q86W47 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNMB4Q86W47 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNMB4Q86W47 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNMB4Q86W47 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNMB4Q86W47 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNMB4Q86W47 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNMB4Q86W47 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNMB4Q86W47 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNMB4Q86W47 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNMB4Q86W47 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNMB4Q86W47 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNMB4Q86W47 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNMB4Q86W47 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNMB4Q86W47 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNMB4Q86W47 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNMB4Q86W47 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNMB4Q86W47 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNMB4Q86W47 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNMB4Q86W47 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNMB4Q86W47 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNMB4Q86W47 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNMB4Q86W47 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNMB4Q86W47 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNMB4Q86W47 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNMB4Q86W47 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNMB4Q86W47 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNMB4Q86W47 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNMB4Q86W47 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNMB4Q86W47 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNMB4Q86W47 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNMB4Q86W47 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNMB4Q86W47 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNMB4Q86W47 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNMB4Q86W47 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNMB4Q86W47 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNMB4Q86W47 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNMB4Q86W47 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNMB4Q86W47 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNMB4Q86W47 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNMB4Q86W47 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNMB4Q86W47 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNMB4Q86W47 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNMB4Q86W47 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNMB4Q86W47 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNMB4Q86W47 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNMB4Q86W47 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNMB4Q86W47 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNMB4Q86W47 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNMB4Q86W47 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNMB4Q86W47 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNMB4Q86W47 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNMB4Q86W47 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNMB4Q86W47 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNMB4Q86W47 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNMB4Q86W47 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNMB4Q86W47 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNMB4Q86W47 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNMB4Q86W47 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNMB4Q86W47 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNMB4Q86W47 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNMB4Q86W47 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNMB4Q86W47 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNMB4Q86W47 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNMB4Q86W47 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNMB4Q86W47 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNMB4Q86W47 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNMB4Q86W47 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNMB4Q86W47 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNMB4Q86W47 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNMB4Q86W47 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNMB4Q86W47 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNMB4Q86W47 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNMB4Q86W47 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNMB4Q86W47 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNMB4Q86W47 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNMB4Q86W47 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNMB4Q86W47 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
KCNMB4Q86W47 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
KCNMB4Q86W47 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.23
KCNMB4Q86W47 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNMB4Q86W47 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNMB4Q86W47 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNMB4Q86W47 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNMB4Q86W47 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNMB4Q86W47 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNMB4Q86W47 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNMB4Q86W47 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNMB4Q86W47 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNMB4Q86W47 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNMB4Q86W47 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNMB4Q86W47 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNMB4Q86W47 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCNMB4Q86W47 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
KCNMB4Q86W47 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCNMB4Q86W47 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCNMB4Q86W47 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms