Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC84Q86UT8 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC84Q86UT8 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC84Q86UT8 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC84Q86UT8 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC84Q86UT8 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC84Q86UT8 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC84Q86UT8 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC84Q86UT8 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC84Q86UT8 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC84Q86UT8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC84Q86UT8 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC84Q86UT8 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC84Q86UT8 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC84Q86UT8 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC84Q86UT8 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC84Q86UT8 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC84Q86UT8 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC84Q86UT8 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC84Q86UT8 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC84Q86UT8 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC84Q86UT8 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC84Q86UT8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC84Q86UT8 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC84Q86UT8 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC84Q86UT8 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC84Q86UT8 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CCDC84Q86UT8 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC84Q86UT8 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC84Q86UT8 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC84Q86UT8 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC84Q86UT8 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC84Q86UT8 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC84Q86UT8 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC84Q86UT8 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC84Q86UT8 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC84Q86UT8 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC84Q86UT8 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC84Q86UT8 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC84Q86UT8 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC84Q86UT8 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC84Q86UT8 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC84Q86UT8 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC84Q86UT8 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC84Q86UT8 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC84Q86UT8 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC84Q86UT8 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC84Q86UT8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC84Q86UT8 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC84Q86UT8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC84Q86UT8 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC84Q86UT8 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC84Q86UT8 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC84Q86UT8 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC84Q86UT8 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC84Q86UT8 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC84Q86UT8 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC84Q86UT8 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC84Q86UT8 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC84Q86UT8 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC84Q86UT8 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC84Q86UT8 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC84Q86UT8 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC84Q86UT8 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC84Q86UT8 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC84Q86UT8 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC84Q86UT8 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC84Q86UT8 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC84Q86UT8 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC84Q86UT8 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC84Q86UT8 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC84Q86UT8 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC84Q86UT8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC84Q86UT8 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC84Q86UT8 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC84Q86UT8 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC84Q86UT8 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC84Q86UT8 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC84Q86UT8 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC84Q86UT8 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC84Q86UT8 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC84Q86UT8 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC84Q86UT8 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC84Q86UT8 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC84Q86UT8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC84Q86UT8 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC84Q86UT8 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC84Q86UT8 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC84Q86UT8 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC84Q86UT8 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC84Q86UT8 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC84Q86UT8 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC84Q86UT8 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC84Q86UT8 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CCDC84Q86UT8 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CCDC84Q86UT8 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC84Q86UT8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC84Q86UT8 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC84Q86UT8 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC84Q86UT8 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms