Protein–RNA interactions for Protein: Q86U70

LDB1, LIM domain-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDB1Q86U70 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LDB1Q86U70 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LDB1Q86U70 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LDB1Q86U70 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LDB1Q86U70 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LDB1Q86U70 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LDB1Q86U70 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LDB1Q86U70 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LDB1Q86U70 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
LDB1Q86U70 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
LDB1Q86U70 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
LDB1Q86U70 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LDB1Q86U70 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LDB1Q86U70 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LDB1Q86U70 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
LDB1Q86U70 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LDB1Q86U70 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LDB1Q86U70 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LDB1Q86U70 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LDB1Q86U70 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LDB1Q86U70 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LDB1Q86U70 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LDB1Q86U70 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LDB1Q86U70 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LDB1Q86U70 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LDB1Q86U70 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LDB1Q86U70 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
LDB1Q86U70 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LDB1Q86U70 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LDB1Q86U70 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LDB1Q86U70 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LDB1Q86U70 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LDB1Q86U70 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LDB1Q86U70 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LDB1Q86U70 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LDB1Q86U70 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LDB1Q86U70 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LDB1Q86U70 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LDB1Q86U70 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LDB1Q86U70 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LDB1Q86U70 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LDB1Q86U70 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LDB1Q86U70 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LDB1Q86U70 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LDB1Q86U70 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LDB1Q86U70 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LDB1Q86U70 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LDB1Q86U70 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LDB1Q86U70 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LDB1Q86U70 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LDB1Q86U70 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LDB1Q86U70 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LDB1Q86U70 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
LDB1Q86U70 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LDB1Q86U70 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LDB1Q86U70 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LDB1Q86U70 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LDB1Q86U70 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LDB1Q86U70 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LDB1Q86U70 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LDB1Q86U70 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LDB1Q86U70 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LDB1Q86U70 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LDB1Q86U70 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LDB1Q86U70 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LDB1Q86U70 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LDB1Q86U70 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LDB1Q86U70 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LDB1Q86U70 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LDB1Q86U70 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LDB1Q86U70 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LDB1Q86U70 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LDB1Q86U70 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
LDB1Q86U70 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LDB1Q86U70 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LDB1Q86U70 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LDB1Q86U70 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LDB1Q86U70 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LDB1Q86U70 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LDB1Q86U70 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LDB1Q86U70 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LDB1Q86U70 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
LDB1Q86U70 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LDB1Q86U70 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LDB1Q86U70 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LDB1Q86U70 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LDB1Q86U70 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LDB1Q86U70 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LDB1Q86U70 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LDB1Q86U70 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LDB1Q86U70 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LDB1Q86U70 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LDB1Q86U70 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LDB1Q86U70 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LDB1Q86U70 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LDB1Q86U70 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LDB1Q86U70 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LDB1Q86U70 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LDB1Q86U70 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LDB1Q86U70 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms