Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z6E9

RBBP6, E3 ubiquitin-protein ligase RBBP6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP6Q7Z6E9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RBBP6Q7Z6E9 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RBBP6Q7Z6E9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RBBP6Q7Z6E9 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RBBP6Q7Z6E9 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RBBP6Q7Z6E9 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RBBP6Q7Z6E9 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RBBP6Q7Z6E9 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
RBBP6Q7Z6E9 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RBBP6Q7Z6E9 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RBBP6Q7Z6E9 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RBBP6Q7Z6E9 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RBBP6Q7Z6E9 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RBBP6Q7Z6E9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RBBP6Q7Z6E9 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RBBP6Q7Z6E9 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RBBP6Q7Z6E9 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RBBP6Q7Z6E9 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RBBP6Q7Z6E9 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RBBP6Q7Z6E9 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
RBBP6Q7Z6E9 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RBBP6Q7Z6E9 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RBBP6Q7Z6E9 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RBBP6Q7Z6E9 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RBBP6Q7Z6E9 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RBBP6Q7Z6E9 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RBBP6Q7Z6E9 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RBBP6Q7Z6E9 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
RBBP6Q7Z6E9 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RBBP6Q7Z6E9 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RBBP6Q7Z6E9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RBBP6Q7Z6E9 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RBBP6Q7Z6E9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RBBP6Q7Z6E9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RBBP6Q7Z6E9 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RBBP6Q7Z6E9 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RBBP6Q7Z6E9 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RBBP6Q7Z6E9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RBBP6Q7Z6E9 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
RBBP6Q7Z6E9 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
RBBP6Q7Z6E9 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC26.33■■□□□ 1.8
RBBP6Q7Z6E9 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
RBBP6Q7Z6E9 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
RBBP6Q7Z6E9 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.8
RBBP6Q7Z6E9 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RBBP6Q7Z6E9 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RBBP6Q7Z6E9 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RBBP6Q7Z6E9 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RBBP6Q7Z6E9 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RBBP6Q7Z6E9 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RBBP6Q7Z6E9 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RBBP6Q7Z6E9 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RBBP6Q7Z6E9 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RBBP6Q7Z6E9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RBBP6Q7Z6E9 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RBBP6Q7Z6E9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RBBP6Q7Z6E9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RBBP6Q7Z6E9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RBBP6Q7Z6E9 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RBBP6Q7Z6E9 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RBBP6Q7Z6E9 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
RBBP6Q7Z6E9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RBBP6Q7Z6E9 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RBBP6Q7Z6E9 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RBBP6Q7Z6E9 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
RBBP6Q7Z6E9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RBBP6Q7Z6E9 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RBBP6Q7Z6E9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RBBP6Q7Z6E9 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RBBP6Q7Z6E9 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RBBP6Q7Z6E9 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
RBBP6Q7Z6E9 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RBBP6Q7Z6E9 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RBBP6Q7Z6E9 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
RBBP6Q7Z6E9 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RBBP6Q7Z6E9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RBBP6Q7Z6E9 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RBBP6Q7Z6E9 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RBBP6Q7Z6E9 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RBBP6Q7Z6E9 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RBBP6Q7Z6E9 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RBBP6Q7Z6E9 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RBBP6Q7Z6E9 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RBBP6Q7Z6E9 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RBBP6Q7Z6E9 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RBBP6Q7Z6E9 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RBBP6Q7Z6E9 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RBBP6Q7Z6E9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RBBP6Q7Z6E9 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RBBP6Q7Z6E9 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RBBP6Q7Z6E9 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RBBP6Q7Z6E9 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RBBP6Q7Z6E9 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RBBP6Q7Z6E9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RBBP6Q7Z6E9 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RBBP6Q7Z6E9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RBBP6Q7Z6E9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RBBP6Q7Z6E9 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RBBP6Q7Z6E9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RBBP6Q7Z6E9 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms